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Enregistrement W2092893864 · doi:10.1525/auk.2013.13064

Identifying the sister species to the rapid capuchino seedeater radiation (Passeriformes:<i>Sporophila</i>)

2013· article· en· W2092893864 sur OpenAlexaff
Leonardo Campagna, Luís Fábio Silveira, Pablo L. Tubaro, Stephen C. Lougheed

Notice bibliographique

RevueThe Auk · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSubspeciesMonophylyBiologyIntrogressionPlumageSister groupPhylogenetic treeZoologyPopulationEvolutionary biologyGenusEcologyCladeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Within the Neotropical genus Sporophila, a group of eight species known colloquially as “southern capuchinos” shows remarkable phenotypic variation despite lack of (species level) mitochondrial DNA monophyly and extremely low differentiation in other putatively neutral genetic markers. Previous studies have interpreted this as reflecting recent common ancestry and, perhaps, ongoing hybridization and introgression. A recent taxonomic revision of the only polytypic southern capuchino species, Sporophila bouvreuil (with four previously recognized subspecies), prompted the designation of S. bouvreuil and S. pileata as two distinct species on the basis of plumage color and geographic distribution. We used DNA sequence and microsatellite data to corroborate these new species designations and explored for the first time the relationship between these taxa and the remaining southern capuchinos. Phylogenetic and population genetic analyses showed that S. bouvreuil and not S. minuta, as was previously thought, is the sister species to the core radiation of which S. pileata is part. Our data suggest that the ancestor of the southern capuchinos is derived from northern South America and began to radiate during the lower to middle Pleistocene into at least eight species within the grasslands of northeastern Argentina, eastern Paraguay, and southern Brazil. Consistent with earlier studies, we could not distinguish among southern capuchino species using neutral genetic markers, an expected signature of a rapid and recent radiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,456
Score d'incertitude au seuil0,457

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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