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Enregistrement W2093224358 · doi:10.1074/jbc.m313678200

Involvement of Glycosylphosphatidylinositol-linked Ceruloplasmin in the Copper/Zinc-Nitric Oxide-dependent Degradation of Glypican-1 Heparan Sulfate in Rat C6 Glioma Cells

2004· article· en· W2093224358 sur OpenAlexaff
Katrin Mani, Fang Cheng, Birgitta Havsmark, Lars‐Âke Fransson

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal General Hospital
Organismes subventionnairesLunds UniversitetUniversiteit van Amsterdam
Mots-clésCeruloplasminHeparan sulfateNitric oxideChemistryCopperZincDegradation (telecommunications)GliomaBiochemistryCell biologyBiophysicsGlycosaminoglycanCancer researchBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The core protein of glypican-1, a glycosylphosphatidylinositol-linked heparan sulfate proteoglycan, can bind Cu(II) or Zn(II) ions and undergo S-nitrosylation in the presence of nitric oxide. Cu(II)-to-Cu(I)-reduction supports extensive and permanent nitrosothiol formation, whereas Zn(II) ions appear to support a more limited, possibly transient one. Ascorbate induces release of nitric oxide, which catalyzes deaminative degradation of the heparan sulfate chains on the same core protein. Although free Zn(II) ions support a more limited degradation, Cu(II) ions support a more extensive self-pruning process. Here, we have investigated processing of glypican-1 in rat C6 glioma cells and the possible participation of the copper-containing glycosylphosphatidylinositol-linked splice variant of ceruloplasmin in nitrosothiol formation. Confocal microscopy demonstrated colocalization of glypican-1 and ceruloplasmin in endosomal compartments. Ascorbate induced extensive, Zn(II)-supported heparan sulfate degradation, which could be demonstrated using a specific zinc probe. RNA interference silencing of ceruloplasmin expression reduced the extent of Zn(II)-supported degradation. In cell-free experiments, the presence of free Zn(II) ions prevented free Cu(II) ion from binding to glypican-1 and precluded extensive heparan sulfate autodegradation. However, in the presence of Cu(II)-loaded ceruloplasmin, heparan sulfate in Zn(II)-loaded glypican-1 underwent extensive, ascorbate-induced degradation. We propose that the Cu(II)-to-Cu(I)-reduction that is required for S-nitrosylation of glypican-1 can take place on ceruloplasmin and thereby ensure extensive glypican-1 processing in the presence of free Zn(II) ions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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