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Enregistrement W2093569046 · doi:10.1111/j.1399-0039.2006.00594.x

The <i>PTPN22 </i>1858T variant is not associated with primary biliary cirrhosis

2006· article· en· W2093569046 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueTissue Antigens · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDiabetes and associated disorders
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalToronto Western HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPTPN22Primary biliary cirrhosisAutoimmune hepatitisSingle-nucleotide polymorphismAlleleAllele frequencyAutoimmune diseaseMedicineImmunologyMinor allele frequencySNPGenotypeAutoantibodyInternal medicineGastroenterologyGeneticsBiologyHepatitisAntibodyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The minor allele of a single nucleotide polymorphism (SNP) in the PTPN22 gene (1858T) encoding the Lyp-tyrosine phosphatase has been recently associated with multiple autoimmune disorders, raising the possibility that this variant may also represent a risk allele for primary biliary cirrhosis (PBC). We therefore investigated the possible association of the PTPN22(1858T) variant with PBC in a Canadian population. We studied 160 Caucasian patients with biopsy and antimitochondrial antibodies (AMA)-proven PBC who were genotyped for the PTPN22(C1858T) SNP using a single-base primer extension assay and mass spectrometry. The frequency of the PTPN22(1858T) allele was then compared between the patients and 290 healthy controls. No association was detected between the PTPN22(1858T) allele and PBC, the frequency of this variant being similar in patients with PBC (7.5%) and controls (8.4%). Restricting the analysis to patients with PBC with any second autoimmune condition or specifically with sicca syndrome or autoimmune thyroid disease also revealed no association with this variant. Thus the PTPN22(1858T) variant is not associated with PBC or with the combination of PBC and a second autoimmune disease. These data suggest that this variant does not confer risk for PBC and does not account for the frequent presence of other autoimmune diseases in patients with PBC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,439
Score d'incertitude au seuil0,591

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle