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Enregistrement W2093595933 · doi:10.1021/np5008558

Glycine-Containing Flaxseed Orbitides

2015· article· en· W2093595933 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Natural Products · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Structural Characterization
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesMinistry of Agriculture - Saskatchewan
Mots-clésChemistryHigh-performance liquid chromatographyTwo-dimensional nuclear magnetic resonance spectroscopyStereochemistryNuclear magnetic resonance spectroscopyLinumChromatographyBiologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Five new orbitides, cyclolinopeptides 21-25, were identified in flaxseed oil (Linum usitatissimum) extracts. Their HPLC-ESIMS quasimolecular ion peaks at m/z 1097.7 (21), 1115.6 (22), 1131.6 (23), 1018.6 (24), and 1034.6 (25) [M + H](+) corresponded to the molecular formulae C59H89N10O10, C58H87N10O10S, C58H87N10O11S, C53H80N9O9S, and C53H80N9O10S, respectively. Their structures were elucidated by extensive HPLC-ESIMS/MS analyses, and their presence was confirmed by precursor proteins identified in flax genomic DNA sequence data. The amino acid sequences of these orbitides were confirmed as [1-10-NαC]-GILVPPFFLI, [1-10-NαC]-GMLIPPFFVI, [1-10-NαC]-GOLIPPFFVI, [1-9-NαC]-GMLVFPLFI, and [1-9-NαC]-GOLVFPLFI for cyclolinopeptides 21-25, respectively. Previously reported orbitides, [1-9-NαC]-ILVPPFFLI (1), [1-9-NαC]-MLIPPFFVI (2), [1-9-NαC]-OLIPPFFVI (3), [1-8-NαC]-MLVFPLFI (7), and [1-8-NαC]-OLVFPLFI (8), were also present in flaxseed oil. The precursors of orbitides 21, 22, and 24 also produced orbitides 1, 2, and 7 by alternative cyclization. Cyclolinopeptides 3, 8, 23, and 25 contain MetO (O) and are not directly encoded, but are products of post-translational modification of the Met present in 2, 7, 22, and 24, respectively. Sufficient cyclolinopeptide 23 was isolated for characterization via 1D ((1)H and (13)C) and 2D (NOESY and HMBC) NMR spectroscopy. These compounds have been named as cyclolinopeptides U, V, W, X, and Y for 21, 22, 23, 24, and 25, respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,273

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle