R5 and X4 HIV Viruses Differentially Modulate Host Gene Expression in Resting CD4 <sup>+</sup> T Cells
Notice bibliographique
Résumé
During HIV-1 infection, distinct biological phenotypes are observed between R5 and X4 HIV-1 strains with respect to pathogenicity and tropism. In this study, temporal changes of the expression levels of the complete human transcriptome, representing 47,000 well-characterized human transcripts, were monitored in the first 24 h during HIV-1 R5 and X4 exposition in resting primary CD4(+) T cells. We provide evidence that R5 viruses modulate, to a greater extent than X4 viruses, the level of mRNA of the resting CD4(+) T cells. Indeed, modulation of the TCR signaling and the actin organization involving the WAVE/ABI complex and the ARP2/3 complex appeared to be associated with R5 exposition. The data suggest that the ability of R5 viruses to modulate TCR-mediated actin polymerization and signaling creates a favorable environment for CD4(+) T cell activation after TCR stimulation and may partly explain why R5 is the primary strain observed early in the natural infection process.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».