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Enregistrement W2094842645 · doi:10.1194/jlr.m200165-jlr200

A novel soluble analog of the HIV-1 fusion cofactor, globotriaosylceramide (Gb3), eliminates the cholesterol requirement for high affinity gp120/Gb3 interaction

2002· article· en· W2094842645 sur OpenAlexaff
Radhia Mahfoud, Murugesapillai Mylvaganam, Clifford A. Lingwood, Jacques Fantini

Notice bibliographique

RevueJournal of Lipid Research · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryAdamantaneGlycosphingolipidBiochemistryViral envelopeGlobotriaosylceramideBiophysicsLipid bilayerStereochemistryMembraneGlycoproteinOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have analyzed the interaction of adamantyl Gb(3) (adaGb(3)), a semi-synthetic soluble analog of Gb(3), with HIV-1 surface envelope glycoprotein gp120. In this analog, which was orginally designed to inhibit verotoxin binding to its glycolipid receptor, Gb(3), the fatty acid chain is replaced with a rigid globular hydrocarbon frame (adamantane). Despite its solubility, adaGb(3) forms monolayers at an air-water interface. Compression isotherms of such monolayers demonstrated that the adamantane substitution resulted in a larger minimum molecular area and a more rigid, less compressible film than Gb(3). Insertion of gp120 into adaGb(3) monolayers was exponential whereas the gp120/Gb(3) interaction curve was sigmoidal with a lag phase of 40 min. Adding cholesterol into authentic Gb(3) monolayers abrogated the lag phase and increased the initial rate of interaction with gp120. This effect of cholesterol was not observed with phosphatidylcholine or sphingomyelin. In addition, verotoxin-bound adaGb(3) or Gb(3) plus cholesterol was recovered in fractions of comparable low density after ultracentrifugation through sucrose-density gradients in the presence of Triton X-100. The unique biological and physico-chemical properties of adaGb(3) suggest that this analog may be a potent soluble mimic of Gb(3), providing a novel concept for developing GSL-derived viral fusion inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,087
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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