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Enregistrement W2095175281 · doi:10.1111/j.1745-4581.2008.00131.x

A PORTABLE RAMAN SYSTEM FOR THE IDENTIFICATION OF FOODBORNE PATHOGENIC BACTERIA

2008· article· en· W2095175281 sur OpenAlexaff
Bingfeng Luo, Min Lin

Notice bibliographique

RevueJournal of Rapid Methods & Automation in Microbiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpectroscopy Techniques in Biomedical and Chemical Research
Établissements canadiensCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRaman spectroscopyMaterials scienceSpectrometerRaman scatteringLaserNanotechnologyOpticsPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Raman spectroscopy is emerging as an important nondestructive, noninvasive, analytical tool for the analysis of biologic materials. This study presents a procedure to make use of commercial off‐the‐shelf components to construct a portable dispersive Raman system and evaluates it for discrimination of bacteria by surface‐enhanced Raman scattering (SERS). The system consists of a semiconductor laser (784.8 nm), a fiber optic probe (∼135 µm focal spot), a mini spectrometer and a computer. UV‐visible spectroscopy and transmission electron microscopy analysis of four silver colloid preparations produced in this study, together with the SERS spectra of Listeria innocua adsorbed on colloidal particles, indicated that silver colloids with the extinction maximum at >415 nm (particle size >75 nm) and a larger long wavelength tail are capable of promoting SERS of bacteria. The SERS spectra of Listeria monocytogenes, Escherichia coli O157:H7 and Salmonella enterica were acquired with the system, leading to an unambiguous identification of these bacterial foodborne pathogens on the basis of their unique spectral bands. This study demonstrated the feasibility of constructing a low‐cost compact Raman system using commercially available components to perform the SERS analysis of bacteria. PRACTICAL APPLICATIONS Commercial off‐the‐shelf components such as a semiconductor laser, a fiber optic probe and a mini spectrometer can be used to construct a portable, low‐cost dispersive Raman system. Such system allows for the acquisition of SERS spectra of bacteria adsorbed on silver colloidal nanoparticles, as exemplified by three important bacterial foodborne pathogens L. monocytogenes (serotype 4b), E. coli O157:H7 and S. enterica (serotype Typhimurium DT 104). An unambiguous identification of these pathogens was achieved based on their unique spectral bands, indicating that an inexpensive dispersive Raman system such as the one described here may be built for the rapid characterization of bacteria isolates from food, clinical and environment samples using SERS spectral fingerprints.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,363
Écart entre enseignants0,343 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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