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Enregistrement W2095499154 · doi:10.1016/j.jasms.2006.09.026

Establishment of mass spectrometric fingerprints of novel synthetic cholesteryl neoglycolipids: The presence of a unique <i>C</i>-glycoside species during electrospray ionization and during collision-induced dissociation tandem mass spectrometry

2006· article· en· W2095499154 sur OpenAlexafffund
Anas El‐Aneed, Joseph Banoub, Mariano Koen‐Alonso, Paul Boullanger, Dominique Lafont

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society for Mass Spectrometry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensFisheries and Oceans CanadaMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésChemistryTandem mass spectrometryOxonium ionElectrospray ionizationGlycosidic bondElectrosprayMass spectrometryAmino sugarFragmentation (computing)DisaccharideChromatographyStereochemistryOrganic chemistryIon

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this study we evaluated the fragmentation pattern of 16 novel amphiphilic neoglycolipid cholesteryl derivatives that can be efficiently used to increase cationic liposomal stability and to enhance gene transfer ability. These neoglycolipids bear different sugar moieties, such as D-glucosamine, N-acetyl-D-glucosamine, N-trideuterioacetyl-D-glucosamine, N-acetyllactosamine, L-fucose, N-allyloxycarbonyl-D-glucosamine, and some of their per-O-acetylated derivatives. Regardless of the structure of the tested neoglycolipid, QqToF-MS analysis using electrospray ionization (ESI) source showed abundant protonated [M+H]+ species. We also identified by both QqToF-MS and low-energy collision tandem mass spectrometry (CID-MS/MS) of the [M+H]+ ion, the presence of specific common fingerprint fragment ions: [Cholestene]+, sugar [oxonium]+, [(Sugar-spacer-OH)+H]+, [oxonium-H2O]+, and [(Cholesterol-spacer-OH)+H]+. In addition, we observed a unique ion that could not be rationally explained by the expected fragmentation of these amphiphilic molecules. The structure of this ion was tentatively proposed with that of a C-glycoside species formed by a chemical reaction between the sugar portion and the cholesterol. MS/MS analysis of this unique [C-glycoside]+ confirmed the validity of the proposed structure of this ion. The presence of an amino group at position C-2 and free hydroxyl groups of the sugar motif is crucial for the formation of a "reactive" sugar oxonium ion that can form the [C-glycoside]+ species. In summary, we precisely established the fragmentation patterns of the tested series of neoglycolipid cholesteryl derivatives and authenticated their structure as well; moreover, we speculated on the formation of a C-glycoside with the ESI source under atmospheric pressure and in the collision cell during MS/MS analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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