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Enregistrement W2095660210 · doi:10.2174/1874070700802010036

Impact of Glycosylation on Saccharomyces cerevisiae Endopolygalacturonase PGU1 Activity and Stability

2008· article· en· W2095660210 sur OpenAlexafffund
Vicky Houle, Mylène Gagnon, Etienne Dubé, Yves Hurtubise, Marc Beauregard

Notice bibliographique

RevueThe Open Biotechnology Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePolysaccharides and Plant Cell Walls
Établissements canadiensUniversité du Québec à Trois-RivièresUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésGlycosylationBiochemistrySaccharomyces cerevisiaeEnzymeN-linked glycosylationChemistryMutagenesisRecombinant DNAMutantProtein engineeringGlycoproteinYeastGeneGlycan

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Endopolygalacturonases are among the best selling enzymes for a number of commercial applications such as food processing. For such enzymes, a potentially important component of production cost is glycosylation. This important modification of endopolygalacturonase has been detected for a number of species, but its real importance has not been thoroughly studied. Here we investigated endopolygalacturonase PGU1 from Saccharomyces cerevisiae CECT 1389 produced in S. cerevisiae INVSc 1. Combinatorial mutagenesis of recombinant S. cerevesiae PGU1 putative glycosylation sites was performed, where asparagines 318 and 330 were replaced with either aspartic acid or glutamine. Electrophoretic analysis of the different recombinant enzymes studied here demonstrates that the putative sites 318 and 330 are indeed glycosylated when produced in S. cerevesiae INVSc 1. The optimal activity of these enzymes was detected at pH 4.5 and 55-60 ºC. As for stability, all enzymes studied were less than 50% active after an incubation of two hours at 50 ºC and at pH between 4.5 and 6.0. Glycosylation did not provide any significant stabilisation of PGU1, but the replacement of Asn 330 with Gln had a deleterious effect on stability. The secondary structure spectra are characteristics of proteins mostly composed of beta sheets. The T m values measured for PGU1, PGU1 deglycosylated with endo H, and three mutants ranged from 53 to 55.4ºC, indicating that glycosylation had no impact on PGU1 conformation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,718
Score d'incertitude au seuil0,714

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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