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Enregistrement W2095845635 · doi:10.5897/ajmr12.1218

Comparative analysis of the miRNA profiles from Taenia solium and Taenia asiatica adult

2014· article· en· W2095845635 sur OpenAlexfundno aff
Lin Ai, Mu-Xin Chen, Yongnian Zhang, Shaohong Chen, Zhou Xiao-Nong, Jiaxu Chen

Notice bibliographique

RevueAfrican Journal of Microbiology Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParasitic infections in humans and animals
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesLanzhou Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural SciencesChinese Academy of Agricultural SciencesState Key Laboratory of Veterinary Etiological BiologyInternational Development Research Centre
Mots-clésTaenia soliumBiologyTaeniaTaeniasisHost (biology)CysticercosisPhylogenetic treeVeterinary medicineVirologyZoologyHelminthsGeneticsGeneMedicineCestode infections

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Taenia solium and Taenia asiatica are zoonotic parasites which are transmitted between pigs and humans, with pigs acting as the intermediate host and humans as the definitive host. The aim of the present study was to compare the microRNA (miRNA) profiles between T. solium and T. asiatica by Solexa deep sequencing and bioinformatic analyses. A total of 18.26 and 15.24 million reads with high quality and three new miRNAs were obtained in each species, respectively. The two cestodes shared nearly the same level of total sRNA, but the known miRNAs were in a very different manner. Nucleotide guanine (G) and uracil (U) were the most frequently used first nucleotide in both T. solium and T. asiatica, respectively. Furthermore, it was also found that there were great differences in the kinds and copy numbers of miRNAs among the two Taenia species, which might indicate the different evolutions in the two parasites. To our knowledge, this is the first report on the characterization of the miRNA profiles for the two Taenia cestodes, and it would lay a foundation for further functional studies of miRNAs of T. solium and T. asiatica.   Key words: Taenia solium, Taenia asiatica, microRNA profiles, human, pig.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,709
Score d'incertitude au seuil0,371

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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