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Enregistrement W2096096063 · doi:10.2174/092986610791498993

Intrinsic Disorder and Function of the HIV-1 Tat Protein

2010· article· en· W2096096063 sur OpenAlex
Shaheen Shojania, Joe D. O’Neil

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueProtein and Peptide Letters · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésIntrinsically disordered proteinsConformational isomerismCircular dichroismRNAChemistryBiophysicsCrystallographyViral proteinProtein structureHuman immunodeficiency virus (HIV)BiologyCell biologyGeneVirusBiochemistryVirologyMolecule

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The type 1 Human Immunodeficiency Virus transcriptional regulator Tat is a small RNA-binding protein essential for viral gene expression and replication. The protein binds to a large number of proteins within infected cells and non-infected cells, and has been demonstrated to impact a wide variety of cellular activities. Early circular dichroism studies showed a lack of regular secondary structure in the protein whereas proton NMR studies suggested several different conformations. Multinuclear NMR structure and dynamics analysis indicates that the reduced protein is intrinsically disordered with a predominantly extended conformation at pH 4. Multiple resonances for several atoms suggest the existence of multiple local conformers in rapid equilibrium. An X-ray diffraction structure of equine Tat, in a complex with its cognate RNA and cyclin T1, supports this conclusion. Intrinsic disorder explains the protein's capacity to interact with multiple partners and effect multiple biological functions; the large buried surface in the X-ray diffraction structure illustrates how a disordered protein can have a high affinity and high specificity for its partners and how disordered Tat assembles a protein complex to enhance transcription elongation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,528
Score d'incertitude au seuil0,234

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle