Investigation of the `switch-epitope' concept with random peptide libraries displayed as thioredoxin loop fusions
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The 'FLITRX' random peptide library, consisting of dodecamer loop peptides displayed on a thioredoxin-flagellin scaffold on Escherichia coli, was used to select peptide sequences with affinity for a monoclonal antibody. These peptides were further screened for pH- and metal-sensitive antibody binding. Several zinc-sensitive peptides were identified, termed 'switch epitopes'. A soluble, monomeric thioredoxin loop ('Trxloop') insertion analog of a FLITRX switch epitope was constructed and its antibody binding properties were characterized by Western blots. Zinc-dependent antibody recognition was maintained in the Trxloop protein although the apparent antibody affinity was lower. This Trxloop protein bound to an immobilized metal affinity chromatography matrix, similar to a 'histidine-patch' thioredoxin variant, and was reversibly precipitated by 1 mM Zn(2+) or Cu(2+) ions. Residues important for zinc and antibody binding were determined by site-directed mutagenesis. The Trxloop antibody affinity was increased by saturation mutagenesis. Biotinylated Trxloop ('Biotrxloop') variants of the original and improved affinity Trxloop proteins were constructed and characterized by surface plasmon resonance measurements. Increased antibody affinity was partially due to a slower antibody desorption rate, although the relative adsorption rates were dependent on the amount of immobilized Biotrxloop protein, indicating an influence of avidity on the apparent affinity.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle