MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2097070618 · doi:10.4269/ajtmh.2012.11-0523

Recommendations for Publication of Viral Genetic Data and Sample Access for Novel Viruses and Strains

2012· article· en· W2097070618 sur OpenAlexafffund
Nicole C. Arrigo, Thomas Briese, Charles H. Calisher, Michael A. Drebot, Brian Hjelle, James W. LeDuc, Ann M. Powers, Patricia M. Repik, John T. Roehrig, Connie S. Schmaljohn, Robert B. Tesh, Scott C. Weaver

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Tropical Medicine and Hygiene · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Vectors
Établissements canadiensPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesMailman School of Public Health, Columbia UniversityAmerican Society of Tropical Medicine and HygieneCenters for Disease Control and PreventionColorado State UniversityCollege of Veterinary Medicine and Biomedical Sciences, Texas A and M UniversityCollege of Veterinary Medicine and Biomedical Sciences, Colorado State UniversityPublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésBiologyVirologyPublic healthVirus classificationOutbreakComputational biologyEvolutionary biologyData scienceGeneticsMedicineGenomeComputer scienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Reference collections of viruses and virus strains representing their temporal, geographic, and phenotypic ranges are critical to basic research and public health. Such collections have proved essential for helping to determine the sources of new outbreaks as well as studying viral pathogenesis, taxonomy, emergence, and evolution. The development and validation of new diagnostics, therapeutics, and vaccines with appropriate breadth of coverage also rely on comprehensive collections

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,075
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,192
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Communication savante
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,994
Score d'incertitude au seuil0,399

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0750,192
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,004
Bibliométrie0,0190,012
Études des sciences et des technologies0,0030,002
Communication savante0,0060,006
Science ouverte0,0080,003
Intégrité de la recherche0,0100,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0530,068

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,175
Tête enseignante GPT0,422
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomainePrésentation des résultats
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAmerican Journal of Tropical Medicine and HygieneMême sujetViral Infections and VectorsTravaux en français237 207