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Enregistrement W2097384181 · doi:10.1128/iai.00572-08

<i>Moraxella catarrhalis</i> Binding to Host Cellular Receptors Is Mediated by Sequence-Specific Determinants Not Conserved among All UspA1 Protein Variants

2008· article· en· W2097384181 sur OpenAlexafffund
Michael J. Brooks, Jennifer L. Sedillo, Nikki J. Wagner, Wei Wang, Ahmed S. Attia, Henry Wong, Cassie A. Laurence, Eric J. Hansen, Scott D. Gray‐Owen

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchU.S. Public Health Service
Mots-clésMoraxella catarrhalisBiologyBacterial adhesinFibronectinCell adhesionCell biologyPlasma protein bindingMicrobiologyReceptorLamininBinding proteinDNA-binding proteinConserved sequenceMoraxella (Branhamella) catarrhalisIntegrinPilusCell adhesion moleculePeptide sequenceCellGeneticsHaemophilus influenzaeVirulenceGeneExtracellular matrixTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Moraxella catarrhalis ubiquitous surface proteins (UspAs) are autotransporter molecules reported to interact with a variety of different host proteins and to affect processes ranging from serum resistance to cellular adhesion. The role of UspA1 as an adhesin has been confirmed with a number of different human cell types and is mediated by binding to eukaryotic proteins including carcinoembryonic antigen-related cellular adhesion molecules (CEACAMs), fibronectin, and laminin. A distinct difference in the ability of prototypical M. catarrhalis strains to adhere to CEACAM-expressing cell lines prompted us to perform strain-specific structure-function analyses of UspA1 proteins. In this study, we characterized CEACAM binding by a diverse set of UspA1 proteins and showed that 3 out of 10 UspA1 proteins were incapable of binding CEACAM. This difference resulted from the absence of a distinct CEACAM binding motif in nonadhering strains. Our sequence analysis also revealed a single M. catarrhalis isolate that lacked the fibronectin-binding motif and was defective in adherence to Chang conjunctival epithelial cells. These results clearly demonstrate that UspA1-associated adhesive functions are not universally conserved. Instead, UspA1 proteins must be considered as variants with the potential to confer both different cell tropisms and host cell responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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