Identification of a Novel Lipopolysaccharide Core Biosynthesis Gene Cluster in <i>Bordetella pertussis</i> , and Influence of Core Structure and Lipid A Glucosamine Substitution on Endotoxic Activity
Notice bibliographique
Résumé
Lipopolysaccharide (LPS), also known as endotoxin, is one of the main constituents of the gram-negative bacterial outer membrane. Whereas the lipid A portion of LPS is generally considered the main determinant for endotoxic activity, the oligosaccharide moiety plays an important role in immune evasion and the interaction with professional antigen-presenting cells. Here we describe a novel four-gene cluster involved in the biosynthesis of the Bordetella pertussis core oligosaccharide. By insertionally inactivating these genes and studying the resulting LPS structures, we show that at least two of the genes encode active glycosyltransferases, while a third gene encodes a deacetylase also required for biosynthesis of full-length oligosaccharide. In addition, we demonstrate that mutations in the locus differentially affect LPS and whole-cell endotoxic activities. Furthermore, while analyzing the mutant LPS structures, we confirmed a novel modification of the lipid A phosphate with glucosamine and found that inactivation of the responsible glycosyltransferase reduces the endotoxic activity of the LPS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».