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Enregistrement W2099335261 · doi:10.1073/pnas.1505870112

Transcription factor PRDM8 is required for rod bipolar and type 2 OFF-cone bipolar cell survival and amacrine subtype identity

2015· article· en· W2099335261 sur OpenAlexafffund
Cynthia C. Jung, Denize Atan, David Ng, Lynda Ploder, Sarah E. Ross, Martin Klein, David G. Birch, Eduardo Diez, Roderick R. McInnes

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensMcGill UniversityHospital for Sick ChildrenJewish General HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthWellcome TrustSight Research UKMacula Vision Research FoundationWellcomeFoundation Fighting Blindness
Mots-clésBiologyAmacrine cellRetinaGeneticsRetinalCell biologyNeuroscienceBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Retinal bipolar (BP) cells mediate the earliest steps in image processing in the visual system, but the genetic pathways that regulate their development and function are incompletely known. We identified PRDI-BF1 and RIZ homology domain containing 8 (PRDM8) as a highly conserved transcription factor that is abundantly expressed in mouse retina. During development and in maturity, PRDM8 is expressed strongly in BP cells and a fraction of amacrine and ganglion cells. To determine whether Prdm8 is essential to BP cell development or physiology, we targeted the gene in mice. Prdm8(EGFP/EGFP) mice showed nonprogressive b-wave deficits on electroretinograms, consistent with compromised BP cell function or circuitry resembling the incomplete form of human congenital stationary night blindness (CSNB). BP cell specification was normal in Prdm8(EGFP/EGFP) retina as determined by VSX2(+) cell numbers and retinal morphology at postnatal day 6. BP subtype differentiation was impaired, however, as indicated by absent or diminished expression of BP subtype-specific markers, including the putative PRDM8 regulatory target PKCα (Prkca) and its protein. By adulthood, rod bipolar (RB) and type 2 OFF-cone bipolar (CB) cells were nearly absent from Prdm8-null mice. Although no change was detected in total amacrine cell (AC) numbers, increased PRKCA(+) and cholinergic ACs and decreased GABAergic ACs were seen, suggesting an alteration in amacrine subtype identity. These findings establish that PRDM8 is required for RB and type 2 OFF-CB cell survival and amacrine subtype identity, and they present PRDM8 as a candidate gene for human CSNB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,077
Score d'incertitude au seuil0,202

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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