A missense mutation in the follicle stimulating hormone receptor (<i>FSHR</i>) gene shows different allele effects on litter size in Chinese Erhualian and German Landrace pigs
Notice bibliographique
Résumé
Summary The follicle stimulating hormone receptor (FSHR) is a unique member of the glycoprotein hormone receptor family. Its expression is highly gonad‐ and cell‐specific, demonstrating its importance for oogenesis and spermatogenesis. Based on published porcine FSHR gene sequence, a pair of primers was designed to amplify a 674‐bp fragment of exon 10. The genetic polymorphism was detected by PCR‐single strand conformation polymorphism (PCR‐SSCP) analysis and a C/T substitution was revealed by direct sequencing of PCR products of putative SSCP homozygotes. This C‐to‐T transition led to an isoleucine 377‐to‐threonine substitution in the porcine FSHR protein. Bi‐directional PCR amplification of specific allele (Bi‐PASA) assay was developed to genotype this C/T substitution on 75 pure Chinese Erhualian (347 litter records) and 113 pure German Landrace sows (501 litter records). The general linear model (GLM) procedure of SAS analysis revealed significant associations of the marker with total piglets born in these two breeds, but showing different allele effects. In Chinese Erhualian pigs, the homozygous T/T genotype was associated with 2.12 and 1.46 piglets more in total born than the homozygous C/C and heterozygous C/T genotype (p = 0.0137). In contrast, German Landrace pigs of homozygote T/T produced 1.92 and 2.14 piglets less in total born than pigs of homozygote C/C and heterozygote C/T (p = 0.0499). This result indicates that genes could interact differently due to the genetic background in livestock species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».