SCE1, the SUMO-Conjugating Enzyme in Plants That Interacts with NIb, the RNA-Dependent RNA Polymerase of Turnip Mosaic Virus, Is Required for Viral Infection
Notice bibliographique
Résumé
SUMOylation, which is catalyzed by small ubiquitin-like modifier (SUMO) enzymes, is a transient, reversible posttranslational protein modification that regulates diverse cellular processes. Potyviruses, the largest group of known plant viruses, comprise many agriculturally important viruses, such as Turnip mosaic virus (TuMV). The potyviral genome encodes 11 mature proteins. To investigate if SUMOylation plays a role in potyvirus infection, a yeast two-hybrid screen was performed to examine possible interactions of each of the 11 viral proteins of TuMV with AtSCE1, the only SUMO-conjugating enzyme in Arabidopsis thaliana homologous to the key SUMO-conjugating enzyme E2 in mammalian cells or Ubc9 in yeast. A positive reaction was found between AtSCE1 and NIb, the potyviral RNA-dependent RNA polymerase. Further bimolecular fluorescence complementation (BiFC) and fluorescence resonance energy transfer (FRET) assays revealed that the NIb and AtSCE1 interaction occurred in both the cytoplasm and nuclei of epidermal cells of Nicotiana benthamiana. The interaction motif was mapped to a region encompassing NIb amino acids 171 to 300 which contains a potential negatively charged amino acid-dependent SUMOylation motif (NDSM). An Escherichia coli SUMOylation assay showed that NIb can be SUMOylated and that the lysine residue (K172) in the motif is a potent SUMOylation site. A TuMV infectious clone with an arginine (R) substitution mutation at K172 compromised TuMV infectivity in plants. In comparison with wild-type Arabidopsis plants, sce1 knockdown plants exhibited increased resistance to TuMV as well as a nonrelated RNA virus. To the best of our knowledge, this is the first report showing that the host SUMO modification system plays an essential role in infection by plant RNA viruses.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».