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Evolution of genes and genomes on the Drosophila phylogeny
Charles F. Aquadro, K. Ravi Ram, Mariana F. Wolfner, Andrew G. Clark, Alex Wong, Nadia D. Singh, Anthony J. Greenberg, Melanie A. Huntley, Amanda M. Larracuente, Laura K. Sirot, Timothy B. Sackton, Daniel A. Barbash, Michael B. Eisen, Roger A. Hoskins, S Celniker, Adrianne B. Brand, Heather Ebling, Robert David, Tao Wei, Stephanie Bosak, Barry E. Garvin, Kevin McKernan, Marc Rubenfield, Jason M. Tsolas, Matthew J. Parisi, Erik Gustafson, David J. Saranga, Douglas R. Smith, Brendan McKernan, Sam Griffiths‐Jones, Casey Bergman, David Sturgill, Brian Oliver, Michael Parisi, Yu Zhang, Therese A. Markow, Thomas D. Watts, Carlos A. Machado, Luciano M. Matzkin, Roberta Kwok, Don Gilbert, Thomas C. Kaufman, Pouya Kheradpour, M. D. Rasmussen, M. Kellis, Leopold Parts, Alan Dupes, David B. Jaffe, Abderrahim Farina, Sante Gnerre, Nga Thi Thuy Nguyen, Terry Shea, Andrew Zimmer, Evan Mauceli, Elizabeth Ryan, Imane Bourzgui, Ngawang Sherpa, Tsering Wangdi, Norbu Dhargay, Marcia Lara, Jinlei Liu, Rebecca Reyes, Helen Vassiliev, Erica Anderson, Shangtao Liu, Tanya Mihova, Tamrat Negash, C. Strader, Teena Mehta, Cecil Rise, Will Brockman, Marc Azer, Choe Norbu, Andrew Hollinger, Stuart Degray, P Fritz, Christopher Patti, Pema Phunkhang, Adam Brown, James C. Meldrim, Lu Shi, Pasang Bachantsang, Jennifer L. Hall, Yeshi Lokyitsang, Annie Lui, Katie D'Aco, Pen MacDonald, Maura Costello, Amr Abdouelleil, Dawa Thoulutsang, Louis Meneus, Mieke Citroen, Jane Wilkinson, Kerstin Lindblad-Toh, Christina R. Gearin, Jerome W. Naylor, Eric Lander, Jean L. Chang, Dmitry Khazanovich, Daniel Bessette, Filip Rege, Sheila Fisher, Iain MacCallum, Aaron Berlin, Jill E. Falk, Valentine Mlenga, Todd Sparrow, Diana M. Shih, Tashi Lokyitsang, Adam Navidi, Chelsea D. Foley, Peter Kisner, Gary Gearin, Xiaohong Liu, Qing Yu, Leanne Hughes, Adam Wilson, Sharleen Grewal, J. Spaulding, Catherine Stone, Asha Kamat, Tsamla Tsamla, F Letendre, Missole Doricent, Vasilia Magnisalis, Alex Lipovsky, Danni Zhong, Barry O'Neill, Allen Alexander, Patrick A. Cooke, St Christophe Acer, Scott Anderson, Justin Abreu, Kunsang Dorjee, John Stalker, Pablo Álvarez, Birhane Hagos, Charles D. Matthews, Yama Thoulutsang, Tashi Bayul, Ira Topping, Erin E. Dooley, R Paul Levine, Passang Dorje, Leonid Boguslavskiy, Geneva Young, Anna Montmayeur, Kunsang Gyaltsen, Riza Daza, Manfred Grabherr, Lisa Chuda, Kerri Topham, Peter Rogov, Edward Grandbois, Kimberly Dooley, Eva Markiewicz, CheeWhye Chin, Tracey Honan, Seva Kashin, Andrew J. Barry, Dennis Friedrich, Robert Nicol, Kebede Maru, Sujaa Raghuraman, Patrick Cahill, William Lee, Sharon Stavropoulos, Tsering Wangchuk, Alville J. Collymore, Richard Elong, Krista Lance, T. Elizabeth Goode, Shailendra Yadav, Rachel Mittelman, Rakela Lubonja, Georgia Giannoukos, Atanas H. Mihalev, Nabil Hafez, Talene Thomson, Lynne Aftuck, Diallo Ferguson, Charlotte Henson, Susan Faro, Jamal Abdulkadir, Jonathan Butler, Nathaniel Novod, Senait Tesfaye, Lisa Zembek, A Franke, Yama Cheshatsang, Brian Hurhula, Nicole Stange-Thomann, Susan McDonough, Harindra Arachi, Niall J. Lennon, Leonidas Mulrain, William McCusker, Toby Bloom, Sampath Settipalli, Michael Weiand, Sahal Osman, Loryn Gadbois, Nyima Norbu, Brikti Abera, Andy H. Vo, Otero L. Oyono, Keenan Ross, Christina R. DeMaso, Oana Mihai, Ben Kanga, Jennifer Baldwin, Adal Abebe, Sheridon Channer, Joseph Graham, Jason Blye, Claude Bonnet, Boris Boukhgalter, Zac Zwirko, Michael Kleber, Magne Husby, Peter An, Margaret Priest, Monika D. Huard, Peili Zhang, William M Gelbart, Angela N. Brooks, Venky N. Iyer, Daniel A Pollard, Alfredo Villasanté, José P. Abad, María Méndez-Lago, Kristi L. Montooth, Dawn N. Abt, David Rand, Derek A. Wilson, Sarah A. Teichmann, Boris Adryan, Alejandro Sánchez‐Gracia, Carmen Segarra, Julio Rozas, Filipe Garrett Vieira, Montserrat Aguadé, Montserrat Papaceit, Albert J. Vilella, Wojciech Makałowski, Xu Mu, Stephen W. Schaeffer, Michael U. Mollenhauer, Gillian Halter, Valer Gotea, Hiroshi Akashi, Wyatt W. Anderson, Eva Freyhult, David H. Ardell, Jian Lü, Manyuan Long, J. Roman Arguello, Jerry A. Coyne, Rama S. Singh, Wilfried Haerty, Santosh Jagadeeshan, Carlo G. Artieri, Daniel Barker, Anastasia Gardiner, Michael G. Ritchie, Paolo Barsanti, Damiano Porcelli, Corrado Caggese, Philip Batterham, Charles Robin, Robert T. Good, Samuel Gross, Serafim Batzoglou, Charles H. Langley, Carolyn S. McBride, Dave Begun, Temple F. Smith, Charles E. Chapple, Roderic Guigò, Anat Caspi, Ian Holmes, Robert K. Bradley, Gabriel Wu, Michael R. Brent, Randall H. Brown, Roger K. Butlin, Brian R. Calvi, Leonardo Barbosa Koerich, Antonio Bernardo Carvalho, Sergio Castrezana, Lior Pachter, Sourav Chatterji, Sandra W. Clifton, Lucinda Fulton, Richard K. Wilson, John Spieth, Asif Chinwalla, LaDeana Hillier, Robert S. Fulton, Jennifer Godfrey, Patrick Minx, Kim D. Delehaunty, Amy Denise Reily, Alberto Civetta, Lisa Levesque, Ana Llopart, Josep M. Comeron, Bryant McAllister, James C. Costello, Mira Han, Jennifer Daub, Michael C. Schatz, Adam M. Phillippy, Steven L. Salzberg, Mihai Pop, Stephen M. Mount, Arthur L. Delcher, Kevin A. Edwards, Thomas Eickbush, Deborah E. Stage, Jay D. Evans, Sven Findeiß, Sudhir Kumar, Alan Filipski, Sonja J. Prohaska, Ana Cristina Lauer Garcia, Vera Lúcia da Silva Valente, Mohamed A. F. Noor, David Garfield, Laura K Reed, Greg Gibson, Brenton Gravely, Peter D. Keightley, Daniel L. Halligan, Robert L. Strausberg, Karin Remington, Brian P. Walenz, Aaron L. Halpern, Granger Sutton, J. Craig Venter, Justin Johnson, Granger G. Sutton, Eli Venter, Ewen F. Kirkness, Angie S. Hinrichs, Jakob Skou Pedersen, Melissa J. Hubisz, Dan Hultmark, Corbin D. Jones, William R. Jeck, William Chester Jordan, Chris D. Smith, Muneo Matsuda, Hajime Sato, Eiko Kataoka, Karsten Kristiansen, Ruiqiang Li, Rod A. Wing, Dave Kudrna, Nicholas Sisneros, Meizhong Luo, Elena R. Lozovsky, Rob J. Kulathinal, Stuart J. Newfeld, Patrick O'Grady, Richard T. Lapoint, Brian P. Lazzaro, Gane Ka‐Shu Wong, Marta Puig, Mar Marzo, Alfredo Ruíz, Eugene W. Myers, Bárbara Negre, Rasmus Nielsen
Notice bibliographique
RevueNature · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of WinnipegArtificial Intelligence in Medicine (Canada)McMaster University
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentU.S. National Library of MedicineNational Institute of General Medical SciencesNational Human Genome Research InstituteBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilNational Institutes of HealthNatural Environment Research CouncilSight Research UKBroad Institute
Mots-clésBiologyGenomeEvolutionary biologyDrosophila virilisDrosophila pseudoobscuraDrosophila (subgenus)Human evolutionary geneticsGeneticsPhylogenetic treeDrosophila melanogasterPhylogeneticsMelanogasterComparative genomicsGeneGenomics
Résumé
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.
Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations2 113
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentnon