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Enregistrement W2099769239 · doi:10.1093/carcin/21.6.1259

Tumors arising in DNA mismatch repair-deficient mice show a wide variation in mutation frequency as assessed by a transgenic reporter gene

2000· article· en· W2099769239 sur OpenAlexaff
Agnes Baross-Francis, M.Kate Milhausen, Susan E. Andrew, Gareth Jevon, Frank R. Jirik

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSomatic hypermutationMSH2BiologyMutationPMS2Lac repressorMutation frequencyTransgeneGeneDNA mismatch repairGenetically modified mouseMolecular biologyCancer researchGene mutationGeneticsReporter geneDNA repairGermline mutationGene expressionRepressorAntibodyB cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We reported previously that thymic lymphomas arising in mice lacking the DNA mismatch repair (MMR) gene, Msh2(-/-), exhibited striking elevations in the mutation frequency of a transgenic lacI reporter gene when compared with normal Msh2(-/-) tissues. To investigate whether hypermutation was a feature of all tumors arising in MMR-deficient mice, lacI transgene mutation frequencies were obtained from several different mouse tumors deficient for PMS2 and/or MSH2. While lacI gene hypermutation was again clearly evident in Msh2 +/- ms2(-/-) and Msh2(-/-)Pms2(-/-) thymic lymphomas, three non-thymic MSH2-deficient tumors failed to show lacI gene mutation frequency elevations when compared with a normal tissue of MMR-deficient mice. The elevated mutation frequencies in the lymphoid tumors, and the finding of multiple clustered mutations in lacI genes rescued from these tumors, suggest that they are possibly generated by a lymphoma-specific hypermutational mechanism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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