γ-Glutamyl transpeptidase acylation with peptidic substrates: free energy relationships measured by an HPLC kinetic assay
Notice bibliographique
Résumé
gamma-Glutamyl transpeptidase (GGT, EC 2.3.2.2) is a highly glycosylated heterodimeric enzyme linked to the external cellular membrane that catalyzes the hydrolysis of glutathione as well as the transfer of its gamma-glutamyl group to amino acids and dipeptides in a transpeptidation reaction. The measurement of both the hydrolytic and transpeptidation activity of this important enzyme is a challenge, since its native substrates are not highly chromogenic. We have developed an HPLC-based method for the quantitative photometric detection of numerous enzyme substrates and products, after their pre-column derivation with dabsyl chloride. The broad applicability of this method was demonstrated in the kinetic investigation of transpeptidation reactions of rat kidney GGT with glutathione, its native substrate, as well as a series of pertinent glutathione analogues. The pH-rate profile constructed for glutathione confirmed the dependence on the ionisation state of at least two residues. Analysis of the free-energy relationships in the series of synthetic peptidic substrate analogues revealed the importance of enzyme-substrate interactions unrelated to amine leaving group basicity during the acylation step. These results are further interpreted in the context of the recently published structure for a similar GGT.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».