Cloning, sequence analysis, and expression of gene <i>alyPI</i> encoding an alginate lyase from marine bacterium <i>Pseudoalteromonas</i> sp. CY24
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The alginate lyase encoding gene (alyPI) of marine bacterium Pseudoalteromonas sp. CY24 was cloned using a battery of PCR techniques. Gene alyPI was composed of a 1575 bp open reading frame encoding a protein of 57.4 kDa containing 524 amino acid residues with a signal peptide of 23 amino acids. The AlyPI protein was expressed in Escherichia coli with a His-tag sequence fused at the C-terminal end and purified to electrophoretic homogeneity using Ni-sepharose affinity chromatography. AlyPI was most active at 40 degrees C and pH 7.0 in the presencce of 0.1 mol/L NaCl and stable over a broad range of pH, 6.0-10.6. The presence of Na+, K+, Mn2+, Ca2+, and Fe3+ can enhance the enzyme activity. The alginate lyase consensus region YFKAGXYXQ, regarded as a striking feature at the C termini of several alginate lyase of ~30 kDa, was found in AlyPI, which belongs to the ~60 kDa group. Another nine amino acid consensus region, YXRSELREM, only found in G-specific alginate lyases previously existed in AlyPI, which could degrade sodium alginate, M blocks, and G blocks and appeared to be a broad substrate-specific alginate lyase.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle