Characterization of the GbpD-activated Rap1 Pathway Regulating Adhesion and Cell Polarity in Dictyostelium discoideum
Notice bibliographique
Résumé
The regulation of cell polarity plays an important role in chemotaxis. GbpD, a putative nucleotide exchange factor for small G-proteins of the Ras family, has been implicated in adhesion, cell polarity, and chemotaxis in Dictyostelium. Cells overexpressing GbpD are flat, exhibit strongly increased cell-substrate attachment, and extend many bifurcated and lateral pseudopodia. These cells overexpressing GbpD are severely impaired in chemotaxis, most likely due to the induction of many protrusions rather than an enhanced adhesion. The GbpD-overexpression phenotype is similar to that of cells overexpressing Rap1. Here we demonstrate that GbpD activates Rap1 both in vivo and in vitro but not any of the five other characterized Ras proteins. In a screen for Rap1 effectors, we overexpressed GbpD in several mutants defective in adhesion or cell polarity and identified Phg2 as Rap1 effector necessary for adhesion, but not cell polarity. Phg2, a serine/threonine-specific kinase, directly interacts with Rap1 via its Ras association domain.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».