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Enregistrement W2101129972 · doi:10.1128/mcb.22.21.7645-7657.2002

Rac2, a Hematopoiesis-Specific Rho GTPase, Specifically Regulates Mast Cell Protease Gene Expression in Bone Marrow-Derived Mast Cells

2002· article· en· W2101129972 sur OpenAlexaff
Yi Gu, Michael C. Byrne, Nivanka C. Paranavitana, Bruce J. Aronow, Jamie E. Siefring, Maria D’Souza, Heidi F. Horton, Lawrence A. Quilliam, David A. Williams

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMast cells and histamine
Établissements canadiensWomen's Health Research Institute
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institutes of HealthHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBiologyRAC1Stem cell factorTranscription factorMast cellCell biologyHaematopoiesisSignal transductionRegulation of gene expressionGene expressionGTPaseRac GTP-Binding ProteinsMolecular biologyGeneStem cellImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rho family GTPases activate intracellular kinase cascades to modulate transcription of multiple genes. Previous studies have examined the roles of the ubiquitously expressed Rho GTPase, Rac1, in regulation of gene expression in cell lines and implicated NF-kappaB, serum response factor, and kinase signaling pathways in this regulation. To understand the role of the closely related but hematopoiesis-specific Rho GTPase, Rac2, in regulation of gene transcription, we compared the gene expression profiles between wild-type and Rac2(-/-) bone marrow-derived mast cells. Our data demonstrate remarkable specificity in the regulation of gene expression by Rac2 versus Rac1. Microarray analysis demonstrated that expression of 38 known genes was significantly altered in Rac2(-/-) mast cells after cytokine stimulation compared with those in wild-type cells. Of these, the expression of the mouse mast cell protease 7 (MMCP-7) gene in wild-type cells was highly induced at the transcriptional level after stimulation with stem cell factor (SCF). In spite of compensatorily increased expression of Rac1 in Rac2-deficient cells, SCF-induced MMCP-7 transcription did not occur. Surprisingly, the loss of MMCP-7 induction was not due to decreased activation of NF-kappaB, a transcription factor postulated to lie downstream of Rac1 and known to play a critical role in hematopoietic cell differentiation and proliferation. However, the activities of c-Jun N-terminal kinases (JNKs) were markedly decreased in Rac2(-/-) mast cells. Our results suggest that cytokine-stimulated activation of MMCP-7 gene transcription is selectively regulated by a Rac2-dependent JNK signaling pathway in primary mast cells and imply a remarkable specificity in the regulation of transcriptional activity by these two highly related Rho GTPases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,066
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,178
Écart entre enseignants0,169 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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