Effects of specific DNMT gene depletion on cancer cell transformation and breast cancer cell invasion; toward selective DNMT inhibitors
Notice bibliographique
Résumé
A hallmark of cancer is aberrant DNA methylation, consisting of global hypomethylation and regional hypermethylation of tumor suppressor genes. DNA methyltransferase inhibitors have been recognized as promising candidate anticancer drugs. Drug development has focused on DNA methylation inhibitors with the goal of activating tumor suppressor genes silenced by DNA methylation. 5-azacytidine (5-AC; Vidaza), a global DNA methyltransferase inhibitor, was Food and Drug Administration approved to treat myelodysplastic syndromes and is clinically tested for solid tumors. In this paper, it was demonstrated that 5'-aza-2'-deoxycytidine (5-azaCdR) activated both silenced tumor suppressor genes and pro-metastatic genes by demethylation, raising the concern that it would promote metastasis. 5-AzaCdR treatment increased the invasiveness of non-invasive breast cancer cell lines MCF-7 cells and ZR-75-1 and dramatically induced pro-metastatic genes; Urokinase plasminogen activator (uPA), matrix metalloproteinase 2 (MMP2), metastasis-associated gene (H-MTS1; S100A4) and C-X-C chemokine receptor 4 (CXCR4). The hypothesis that the blocking of cellular transformation activity of DNA methyltransferase inhibitor could be separated from the pro-metastatic activity was tested using short interfering RNA (siRNA) targeted to the different DNA methyltransferase (DNMT) genes. Although depletion of DNMT1 had the strongest effect on colony growth suppression in cellular transformation assays, it did not result in demethylation and activation of uPA, S100A4, MMP2 and CXCR4 in MCF-7 cells. Depletion of DNMT1 did not induce cellular invasion in MCF-7 and ZR-75-1 non-invasive breast cancer cell lines. These data have implications on the design of new DNA methyltransferase inhibitor and on the proper utilization of current inhibitors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».