Epigenetic Changes During Mechanically Induced Osteogenic Lineage Commitment
Notice bibliographique
Résumé
Osteogenic lineage commitment is often evaluated by analyzing gene expression. However, many genes are transiently expressed during differentiation. The availability of genes for expression is influenced by epigenetic state, which affects the heterochromatin structure. DNA methylation, a form of epigenetic regulation, is stable and heritable. Therefore, analyzing methylation status may be less temporally dependent and more informative for evaluating lineage commitment. Here we analyzed the effect of mechanical stimulation on osteogenic differentiation by applying fluid shear stress for 24 hr to osteocytes and then applying the osteocyte-conditioned medium (CM) to progenitor cells. We analyzed gene expression and changes in DNA methylation after 24 hr of exposure to the CM using quantitative real-time polymerase chain reaction and bisulfite sequencing. With fluid shear stress stimulation, methylation decreased for both adipogenic and osteogenic markers, which typically increases availability of genes for expression. After only 24 hr of exposure to CM, we also observed increases in expression of later osteogenic markers that are typically observed to increase after seven days or more with biochemical induction. However, we observed a decrease or no change in early osteogenic markers and decreases in adipogenic gene expression. Treatment of a demethylating agent produced an increase in all genes. The results indicate that fluid shear stress stimulation rapidly promotes the availability of genes for expression, but also specifically increases gene expression of later osteogenic markers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».