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Enregistrement W2102141071 · doi:10.1128/aem.01225-07

Different Genotypes of Anatoxin-Producing Cyanobacteria Coexist in the Tarn River, France

2007· article· en· W2102141071 sur OpenAlexfundno aff
Sabrina Cadel-Six, Caroline Peyraud-Thomas, Luc Brient, Nicole Tandeau de Marsac, Rosmarie Rippka, Annick Méjean

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAquatic Ecosystems and Phytoplankton Dynamics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCentre National de la Recherche ScientifiqueAgence Française de Sécurité Sanitaire de l'Environnement et du TravailInstitut national de la recherche scientifique
Mots-clésCyanobacteriaOscillatoriaBiologyAxenicGenusBotanyGenotypeBacteriaGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Repeated dog deaths occurred in 2002, 2003, and 2005 after the animals drank water from the shoreline of the Tarn River in southern France. Signs of intoxication indicated acute poisoning due to a neurotoxin. Floating scum and biofilms covering pebbles were collected in the summers of 2005 and 2006 from six different sites along 30 km from the border of this river. The cyanobacterial neurotoxic alkaloid anatoxin-a and/or its methyl homolog, homoanatoxin-a, was detected in the extracts of most samples examined by gas chromatography-mass spectrometry. Fifteen filamentous cyanobacteria of the order Oscillatoriales were isolated and displayed four distinct phenotypes based on morphological characteristics and pigmentation. Three of the phenotypes can be assigned to the genus Oscillatoria or Phormidium, depending on the taxonomic treatises (bacteriological/botanical) employed for identification. The fourth phenotype is typical of the genus Geitlerinema Anagnostidis 1989. Eight strains rendered axenic were analyzed for production of anatoxin-a and homoanatoxin-a, and all strains of Oscillatoria/Phormidium proved to be neurotoxic. The genetic relatedness of the new isolates was evaluated by comparison of the intergenic transcribed spacer sequences with those of six oscillatorian strains from the Pasteur Culture Collection of Cyanobacteria. These analyses showed that the neurotoxic representatives are composed of five different genotypes, three of which correspond to phenotypes isolated in this study. Our findings prove that neurotoxic oscillatorian cyanobacteria exist in the Tarn River and thus were most likely implicated in the reported dog poisonings. Furthermore, they reemphasize the importance of monitoring benthic cyanobacteria in aquatic environments to fully assess the health risks associated with these organisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,749
Score d'incertitude au seuil0,406

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,177
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations140
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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