NLRP3 and ASC Differentially Affect the Lung Transcriptome during Pneumococcal Pneumonia
Notice bibliographique
Résumé
Streptococcus pneumoniae is the most frequently isolated causative pathogen of community-acquired pneumonia, a leading cause of mortality worldwide. Inflammasomes are multiprotein complexes that play crucial roles in the regulation of inflammation. Nod-like receptor family, pyrin domain containing (NLRP) 3 is a sensor that functions in a single inflammasome, whereas adaptor apoptosis-associated speck-like protein containing a caspase activation and recruitment domain (ASC) is a common adaptor of several inflammasomes. We investigated the role of NLRP3 and ASC during S. pneumoniae pneumonia by comparing bacterial growth and spreading, and host innate immune responses in wild-type mice and mice deficient for either NLRP3 (Nlrp3(-/-)) or ASC (Asc(-/-)). Asc(-/-) mice had increased bacterial dissemination and lethality compared with Nlrp3(-/-) mice, although the cytokine response was impaired in both mouse strains. By detailed analysis of the early inflammatory response in the lung by whole-genome transcriptional profiling, we identified several mediators that were differentially expressed between Nlrp3(-/-) and Asc(-/-) mice. Of these, IL-17, granulocyte/macrophage colony-stimulating factor, and integrin-αM were significantly attenuated in Asc(-/-) relative to Nlrp3(-/-) mice, as well as a number of genes involved in the adaptive immune response. These differences may explain the increased susceptibility of Asc(-/ -) mice during S. pneumoniae infection, and suggest that either ASC-dependent NLRP3-independent inflammasomes or inflammasome-independent ASC functions may be involved.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».