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Enregistrement W2102634757 · doi:10.1080/07060661.2011.627950

Physiologic specialization of<i>Puccinia triticina</i>, the causal agent of wheat leaf rust, in Canada in 2008

2011· article· en· W2102634757 sur OpenAlexaffvenueabout
Brent McCallum, P. Seto-Goh, Allen Xue

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesSolar Energy Technologies Office
Mots-clésVirulenceWheat leaf rustRust (programming language)BiologyPuccinia reconditaSeedlingPhenotypeGeneVeterinary medicineBotanyGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Commercial fields and research plots of wheat across Canada were surveyed for leaf rust during 2008. Leaf samples infected with the causal fungus, Puccinia triticina, were used to generate 407 single pustule isolates, 13 from Alberta, 302 from Manitoba and Saskatchewan, 71 from Ontario, 10 from Quebec and 11 from Prince Edward Island. Single pustule isolates were tested for virulence to 16 lines of ‘Thatcher’ wheat with single leaf rust resistance genes. Forty-six virulence phenotypes were identified; the most common were TDBJ (23.6%), TDBG (23.1%) and MLDS (18.9%). The frequency of virulence to both Lr9 and Lr17 increased compared with 2007, whereas it decreased for Lr24 and Lr2a. The populations from eastern Canada were more diverse than those from western Canada and contained many unique virulence phenotypes, and virulence to gene Lr18, which was not found in western Canada. Fifty-five isolates, representing each of the virulence phenotypes, were tested on six and 12 additional differential wheat lines at the adult and seedling stages, respectively. On the adult plant differentials, no isolates were virulent to Lr22a or Lr34, whereas all isolates except two were virulent to Lr13, and virulence varied for Lr12, Lr35 and Lr37. On the additional seedling differentials, all isolates were avirulent to Lr19, Lr21, Lr29 and Lr32, and only one isolate was virulent to Lr25. All isolates had similar infection types to Lr2b and Lr2a, varied in virulence to Lr3bg, Lr14b, Lr20, Lr23 and Lr28, and except for two were virulent to Lr15.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,093

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,152 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations124
Publié2011
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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