Polybasic Trafficking Signal Mediates Golgi Export, ER Retention or ER Export and Retrieval Based on Membrane-Proximity
Notice bibliographique
Résumé
Trafficking of integral membrane proteins between the ER and Golgi complex, and protein sorting and trafficking between the TGN and endosomal/lysosomal compartments or plasma membranes, are dependent on cis-acting, linear amino acid sorting signals. Numerous sorting signals of this type have been identified in the cytoplasmic domains of membrane proteins, several of which rely on basic residues. A novel Golgi export signal that relies on a membrane-proximal polybasic motif (PBM) was recently identified in the reptilian reovirus p14 protein, a representative of an unusual group of bitopic fusion-associated small transmembrane (FAST) proteins encoded by fusogenic orthoreoviruses and responsible for cell-cell fusion and syncytium formation. Using immunofluorescence microscopy, cell surface immunofluorescence, and endoglycosidase H assays, we now show the p14 PBM can mediate several distinct trafficking functions depending on its proximity to the transmembrane domain (TMD). When present within 4-residues of the TMD it serves as a Golgi export signal, but when located at the C-terminus of the 68-residue p14 cytoplasmic endodomain it functions as an ER retention signal. The PBM has no effect on protein trafficking when located at an internal position in the cytoplasmic domain. When present in both membrane-proximal and -distal locations, the PBMs promote export to, and efficient retrieval from, the Golgi complex. Interestingly, the conflicting trafficking signals provided by two PBMs induces extensive ER tubulation and segregation of ER components. These studies highlight how a single trafficking signal in a simple transmembrane protein can have remarkably diverse, position-dependent effects on protein trafficking and ER morphogenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».