Lipid Trafficking Controls Endotoxin Acylation in Outer Membranes of Escherichia coli
Notice bibliographique
Résumé
The biogenesis of biological membranes hinges on the coordinated trafficking of membrane lipids between distinct cellular compartments. The bacterial outer membrane enzyme PagP confers resistance to host immune defenses by transferring a palmitate chain from a phospholipid to the lipid A (endotoxin) component of lipopolysaccharide. PagP is an eight-stranded antiparallel beta-barrel, preceded by an N-terminal amphipathic alpha-helix. The active site is localized inside the beta-barrel and is aligned with the lipopolysaccharide-containing outer leaflet, but the phospholipid substrates are normally restricted to the inner leaflet of the asymmetric outer membrane. We examined the possibility that PagP activity in vivo depends on the aberrant migration of phospholipids into the outer leaflet. We find that brief addition to Escherichia coli cultures of millimolar EDTA, which is reported to replace a fraction of lipopolysaccharide with phospholipids, rapidly induces palmitoylation of lipid A. Although expression of the E. coli pagP gene is induced during Mg2+ limitation by the phoPQ two-component signal transduction pathway, EDTA-induced lipid A palmitoylation occurs more rapidly than pagP induction and is independent of de novo protein synthesis. EDTA-induced lipid A palmitoylation requires functional MsbA, an essential ATP-binding cassette transporter needed for lipid transport to the outer membrane. A potential role for the PagP alpha-helix in phospholipid translocation to the outer leaflet was excluded by showing that alpha-helix deletions are active in vivo. Neither EDTA nor Mg(2+)-EDTA stimulate PagP activity in vitro. These findings suggest that PagP remains dormant in outer membranes until Mg2+ limitation promotes the migration of phospholipids into the outer leaflet.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».