LOTUS, a new domain associated with small RNA pathways in the germline
Notice bibliographique
Résumé
We describe here LOTUS, a hitherto uncharacterized small globular domain, which was identified using sensitive sequence profile analysis. The LOTUS domain is found in germline-specific proteins that are present in the nuage/polar granules of germ cells. TDRD5 and TDRD7, two mammalian members of the germline Tudor group, possess three copies of the LOTUS domain in their extreme N-termini. The Tudor domains of these proteins bind symmetric dimethyl arginines present on the germ cell-specific Piwi proteins, which form a particular clade of Argonaute proteins. Piwi proteins interact with a specific class of non-coding RNAs [piwi-interacting RNAs (piRNAs)] and play a key role in the repression (silencing) of transposons and possibly other germline-specific functions. A LOTUS domain is also present in the Oskar protein, a critical component of the pole plasm in the Drosophila oocyte, which is required for germ cell formation. LOTUS domains are found in various proteins from metazoans and plants, are often associated with RNA-specific modules and are likely to adopt a winged helix fold. This suggests a germline-specific role in the mRNA localization and/or translation or a specific function toward piRNAs.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».