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Enregistrement W2103187960 · doi:10.1111/j.1567-1364.2010.00652.x

Five novel anamorphic, ascomycetous yeast species associated with mushrooms and soil

2010· article· en· W2103187960 sur OpenAlexfundno aff
Chin-Wen Hsieh, Li-Ying Huang, Edelgard Fu-Tschin Tschen, Chin‐Feng Chang, Ching-Fu Lee

Notice bibliographique

RevueFEMS Yeast Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYeasts and Rust Fungi Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBeef Cattle Research CouncilNational Science Council
Mots-clésBiologyCladePhylogenetic treeYeastRibosomal RNAAscomycotaBotanyPhylogeneticsBasidiomycotaMicrobiologyInternal transcribed spacerGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Five novel yeast species belonging to the Kodamaea clade are proposed in this paper based on nine strains isolated from mushrooms and soil in Taiwan between 2007 and 2008. These nine yeast strains were found to represent five novel yeast species based on their D1/D2 domain sequences of the large subunit (LSU) rRNA gene and physiological characteristics. Sequence analysis of the D1/D2 domain of the LSU rRNA gene revealed that the five species are phylogenetically related to Kodamaea and Candida sp. clustered into the Kodamaea clade in the phylogenetic tree. All the species reproduced asexually, and no ascospores could be found. Therefore, the scientific names of Candida alishanica sp. nov., Candida hsintzibuensis sp. nov., Candida kaohsiungensis sp. nov., Candida lidongshanica sp. nov., and Candida smagusa sp. nov. were proposed to accommodate these strains. Strains of the first species were discovered from soil; two strains of the second species were isolated from soil and the fruiting body of a mushroom, respectively; and strains of the latter three species were recovered from fruiting bodies of mushrooms. The type strains are listed as follows: C. alishanica GY43S11(T) (=CBS 11429(T) =BCRC 23188(T) ); C. hsintzibuensis EJ7S06(T) (=CBS 11427(T) =BCRC 23183(T) ); C. kaohsiungensis GJ10M01(T) (=CBS 11435(T) =BCRC 23197(T) ); C. lidongshanica SD5S01(T) (=CBS 11426(T) =BCRC 23191(T) ); and C. smagusa EN4M03(T) (=CBS 11430(T) =BCRC 23186(T) ).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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