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Enregistrement W2103192992 · doi:10.1042/bj20101375

Protein 4.2 interaction with hereditary spherocytosis mutants of the cytoplasmic domain of human anion exchanger 1

2010· article· en· W2103192992 sur OpenAlexafffund
Susan P. Bustos, Reinhart A.F. Reithmeier

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueErythrocyte Function and Pathophysiology
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBand 3BiologyCytoplasmHereditary spherocytosisMutantHEK 293 cellsSubcellular localizationMutant proteinEndoplasmic reticulumWild typeTransport proteinVesicle-associated membrane protein 8Membrane proteinProtein subcellular localization predictionMolecular biologyCell biologyGene isoformBiochemistryGeneGeneticsMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AE1 (anion exchanger 1) and protein 4.2 associate in a protein complex bridging the erythrocyte membrane and cytoskeleton; disruption of the complex results in unstable erythrocytes and HS (hereditary spherocytosis). Three HS mutations (E40K, G130R and P327R) in cdAE1 (the cytoplasmic domain of AE1) occur with deficiencies of protein 4.2. The interaction of wild-type AE1, AE1HS mutants, mdEA1 (the membrane domain of AE1), kAE1 (the kidney isoform of AE1) and AE1SAO (Southeast Asian ovalocytosis AE1) with protein 4.2 was examined in transfected HEK (human embryonic kidney)-293 cells. The HS mutants had wild-type expression levels and plasma-membrane localization. Protein 4.2 expression was not dependent on AE1. Protein 4.2 was localized throughout the cytoplasm and co-localized at the plasma membrane with the HS mutants mdAE1 and kAE1, but at the ER (endoplasmic reticulum) with AE1SAO. Pull-down assays revealed diminished levels of protein 4.2 associated with the HS mutants relative to AE1. The mdAE1 did not bind protein 4.2, whereas kAE1 and AE1SAO bound wild-type amounts of protein 4.2. A protein 4.2 fatty acylation mutant, G2A/C173A, had decreased plasma-membrane localization compared with wild-type protein 4.2, and co-expression with AE1 enhanced its plasma-membrane localization. Subcellular fractionation showed the majority of wild-type and G2A/C173A protein 4.2 was associated with the cytoskeleton of HEK-293 cells. The present study shows that cytoplasmic HS mutants cause impaired binding of protein 4.2 to AE1, leaving protein 4.2 susceptible to loss during erythrocyte development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,520

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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