Universal primer cocktails for fish DNA barcoding

2007· article· en· 1 492 citations· W2103330559 sur OpenAlex· 10.1111/j.1471-8286.2007.01748.x

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,018

Tête enseignante GPT0,281

Écart entre enseignants: 0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation: score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

Abstract Reliable recovery of the 5′ region of the cytochrome c oxidase 1 (COI) gene is critical for the ongoing effort to gather DNA barcodes for all fish species. In this study, we develop and test primer cocktails with a view towards increasing the efficiency of barcode recovery. Specifically, we evaluate the success of polymerase chain reaction amplification and the quality of resultant sequences using three primer cocktails on DNA extracts from representatives of 94 fish families. Our results show that M13‐tailed primer cocktails are more effective than conventional degenerate primers, allowing barcode work on taxonomically diverse samples to be carried out in a high‐throughput fashion.

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La notice

Revue: Molecular Ecology Notes
Thématique: Identification and Quantification in Food
Domaine: Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Établissements canadiens: University of Guelph
Organismes subventionnaires: Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsOntario Innovation TrustOntario Genomics InstituteGenome CanadaGordon and Betty Moore Foundation
Mots-clés: Primer (cosmetics)BiologyDNA barcodingBarcodePolymerase chain reactionComputational biologyGeneticsFisheryGeneEvolutionary biologyComputer scienceChemistry
Résumé présent dans OpenAlex: oui
API: /api/v1/works/W2103330559