MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2104124522 · doi:10.1126/science.aab3884

Genomic evidence for the Pleistocene and recent population history of Native Americans

2015· article· en· W2104124522 sur OpenAlexaff
Maanasa Raghavan, Matthias Steinrücken, Kelley Harris, Stephan Schiffels, Simon Rasmussen, Michael DeGiorgio, Anders Albrechtsen, Cristina Valdiosera, María C. Ávila‐Arcos, Anna‐Sapfo Malaspinas, Anders Eriksson, Ida Moltke, Mait Metspalu, Julian R. Homburger, Jeff Wall, Omar E. Cornejo, J. Víctor Moreno-Mayar, Thorfinn Sand Korneliussen, Tracey Pierre, Morten Rasmussen, Paula F. Campos, Peter de Barros Damgaard, Morten E. Allentoft, John Lindo, Ene Metspalu, Ricardo Varela, Josefina Mansilla Lory, Celeste Henrickson, Andaine Seguin‐Orlando, Helena Malmström, Thomas Stafford, Suyash Shringarpure, Andrés Moreno‐Estrada, Monika Karmin, Kristiina Tambets, Anders Bergström, Yali Xue, Vera Warmuth, A. D. Friend, Joy Singarayer, Paul J. Valdes, François Balloux, Ilán Leboreiro, José Luis Vera, Héctor Rangel‐Villalobos, Davide Pettener, Donata Luiselli, Loren G. Davis, Évelyne Heyer, Christoph P. E. Zollikofer, Marcia S. Ponce de León, Colin Smith, Vaughan Grimes, Kelly-Anne Pike, Michael Deal, Benjamin T. Fuller, Bernardo Arriaza, Vivien G. Standen, Maria Francisca Luz, François‐Xavier Ricaut, Niède Guidon, L. P. Osipova, Mikhail I. Voevoda, Olga L. Posukh, Oleg Balanovsky, Maria Lavryashina, Yuri Bogunov, Э. К. Хуснутдинова, Marina Gubina, Elena Balanovska, С.А. Федорова, Sergey Litvinov, B. А. Malyarchuk, М. В. Деренко, M. J. Mosher, David Archer, Jerome S. Cybulski, Barbara Petzelt, Joycelynn Mitchell, Rosita Worl, Paul J. Norman, Peter Parham, Brian M. Kemp, Toomas Kivisild, Chris Tyler-Smith, Manjinder S. Sandhu, Michael Crawford, Richard Villems, David Glenn Smith, Michael R. Waters, Ted Goebel, John R. Johnson, Ripan S. Malhi, Mattias Jakobsson, David J. Meltzer, Andrea Manica, Richard Durbin, Carlos D. Bustamante, Yun S. Song, Rasmus Nielsen, Eske Willerslev

Notice bibliographique

RevueScience · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueForensic and Genetic Research
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityWestern UniversityCoast Mountain CollegeMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesH2020 European Research CouncilEuropean Regional Development FundAustralian Research CouncilNational Institute of General Medical SciencesH. Lundbeck A/SRussian Science FoundationWenner-Gren StiftelsernaEuropean CommissionEesti TeadusfondiMinisterio de Ciencia e InnovaciónLundbeckfondenNational Human Genome Research InstituteRussian Foundation for Basic ResearchWellcome TrustBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDanmarks GrundforskningsfondWashington State UniversityDirectorate for Biological SciencesNational Institutes of HealthSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungLa Trobe UniversitySocial Science Research CouncilConsejo Nacional de Ciencia y TecnologíaNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesRussian Academy of SciencesAgence Nationale de la RechercheVillum FondenNational Science FoundationWellcomeWenner-Gren Foundation
Mots-clésPleistoceneEvolutionary biologyPopulationGeographyBiologyGenealogyHistoryArchaeologyDemographySociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

How and when the Americas were populated remains contentious. Using ancient and modern genome-wide data, we found that the ancestors of all present-day Native Americans, including Athabascans and Amerindians, entered the Americas as a single migration wave from Siberia no earlier than 23 thousand years ago (ka) and after no more than an 8000-year isolation period in Beringia. After their arrival to the Americas, ancestral Native Americans diversified into two basal genetic branches around 13 ka, one that is now dispersed across North and South America and the other restricted to North America. Subsequent gene flow resulted in some Native Americans sharing ancestry with present-day East Asians (including Siberians) and, more distantly, Australo-Melanesians. Putative "Paleoamerican" relict populations, including the historical Mexican Pericúes and South American Fuego-Patagonians, are not directly related to modern Australo-Melanesians as suggested by the Paleoamerican Model.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,131
Tête enseignante GPT0,373
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations571
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScienceMême sujetForensic and Genetic ResearchTravaux en français237 207