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Enregistrement W2104191615 · doi:10.1074/jbc.m203285200

Congenital Disorders of Glycosylation Type Ig Is Defined by a Deficiency in Dolichyl-P-mannose:Man7GlcNAc2-PP-dolichyl Mannosyltransferase

2002· article· en· W2104191615 sur OpenAlexfundno aff
Isabelle Chantret, Thierry Dupré, Christophe Delenda, Stéphanie Bucher, Julia Dancourt, Anne Barnier, Aude Charollais, Delphine Héron, Brigitte Bader‐Meunier, Olivier Danos, Nathalie Séta, Geneviève Durand, Rafaël Oriol, Patrice Codogno, Stuart Moore

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMerck Canada
Mots-clésDolicholGlycosylationGlycoproteinMannoseBiologyEndoplasmic reticulumGenePhenotypeBiochemistryMolecular biologyBiosynthesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Type I congenital disorders of glycosylation (CDG I) are diseases presenting multisystemic lesions including central and peripheral nervous system deficits. The disease is characterized by under-glycosylated serum glycoproteins and is caused by mutations in genes encoding proteins involved in the stepwise assembly of dolichol-oligosaccharide used for protein N-glycosylation. We report that fibroblasts from a type I CDG patient, born of consanguineous parents, are deficient in their capacity to add the eighth mannose residue onto the lipid-linked oligosaccharide precursor. We have characterized cDNA corresponding to the human ortholog of the yeast gene ALG12 that encodes the dolichyl-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-dolichyl alpha6-mannosyltransferase that is thought to accomplish this reaction, and we show that the patient is homozygous for a point mutation (T571G) that causes an amino acid substitution (F142V) in a conserved region of the protein. As the pathological phenotype of the fibroblasts of the patient was largely normalized upon transduction with the wild type gene, we demonstrate that the F142V substitution is the underlying cause of this new CDG, which we suggest be called CDG Ig. Finally, we show that the fibroblasts of the patient are capable of the direct transfer of Man(7)GlcNAc(2) from dolichol onto protein and that this N-linked structure can be glucosylated by UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase in the endoplasmic reticulum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,709

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations137
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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