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Enregistrement W2104403020 · doi:10.1128/jvi.00620-09

The Transmembrane Domain of BST-2 Determines Its Sensitivity to Down-Modulation by Human Immunodeficiency Virus Type 1 Vpu

2009· article· en· W2104403020 sur OpenAlexafffund
Liwei Rong, Jianyong Zhang, Jennifer Lu, Qinghua Pan, René-Pierre Lorgeoux, Claudette Aloysius, Fei Guo, Shan‐Lu Liu, Mark A. Wainberg, Chen Liang

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Foundation for AIDS Research
Mots-clésTetherinTransmembrane proteinTransmembrane domainBiologyVirologyCell biologyViral replicationVirusGeneticsReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bone marrow stromal cell antigen 2 (BST-2, also known as tetherin) restricts the production of a number of enveloped viruses by blocking virus release from the cell surface. This antiviral activity is counteracted by such viral factors as Vpu of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1). Here, we report that Vpu antagonizes human BST-2 but not BST-2 derived from African green monkeys. The determinants of susceptibility to Vpu map to the transmembrane domain of BST-2. In accordance with this, expression of human BST-2 containing a modified transmembrane domain effectively blocks the replication of wild-type Vpu-expressing HIV-1 in CD4+ T cells. Furthermore, these BST-2 variants, as opposed to wild-type human BST-2, are refractory to Vpu-mediated down-regulation as a result of an attenuated interaction with Vpu. In view of the work by others pointing to a key role of the transmembrane domain of Vpu in promoting virus release, our data suggest that a direct interaction through the transmembrane domain of each of these two proteins is a prerequisite for Vpu to down-modulate BST-2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,211
Score d'incertitude au seuil0,303

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations113
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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