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Enregistrement W2104462112 · doi:10.1128/mcb.02025-05

Critical Role for a Single Leucine Residue in Leukemia Induction by E2A-PBX1

2006· article· en· W2104462112 sur OpenAlexafffund
Richard Bayly, Takayuki Murase, Brandy D. Hyndman, Rachel Savage, Salima Nurmohamed, Kim Munro, Richard Casselman, Steven P. Smith, David P. LeBrun

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchQueen's University
Mots-clésBiologyTranscription factorCoactivatorCell biologyDNA-binding proteinFusion proteinMolecular biologyHomeoboxGeneticsGeneRecombinant DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In roughly 5% of cases of acute lymphoblastic leukemia, a chromosomal translocation leads to expression of the oncogenic protein E2A-PBX1. The N-terminal portion of E2A-PBX1, encoded by the E2A gene, is identical in sequence to the corresponding portion of the E proteins E12/E47 and includes transcriptional activation domains. The C terminus consists of most of the HOX interacting transcription factor PBX1, including its DNA-binding homeodomain. Structure-function correlative experiments have suggested that oncogenesis by E2A-PBX1 requires an activation domain, called AD1, at the extreme N terminus. We recently demonstrated that a potentially helical portion of AD1 interacts directly with the transcriptional coactivator protein cyclic AMP response element-binding protein (CBP) and that this interaction is essential in the immortalization of primary bone marrow cells in tissue culture. Here we show that a conserved LXXLL motif within AD1 is required in the interaction between E2A-PBX1 and the KIX domain of CBP. We show by circular dichroism spectroscopy that the LXXLL-containing portion of AD1 undergoes a helical transition upon interacting with the KIX domain and that amino acid substitutions that prevent helix formation prevent both the KIX interaction and cell immortalization by E2A-PBX1. Perhaps most strikingly, substitution of a single, conserved leucine residue (L20) within the LXXLL motif impairs leukemia induction in mice after transplantation with E2A-PBX1-expressing bone marrow. The KIX domain of CBP mediates well-characterized interactions with several transcription factors of relevance to leukemia induction. Circumstantial evidence suggests that the side chain of L20 might interact with a deep hydrophobic pocket in the KIX domain. Therefore, our results serve to identify a potential new drug target.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,741

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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