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Enregistrement W2104516368 · doi:10.1139/w2012-039

Nonutility of routine testing of stool for ova and parasites in a tertiary care Canadian centre

2012· article· en· W2104516368 sur OpenAlexaffvenueabout
Mahmoud Mosli, Jamie Gregor, Nilesh Chande, Robert Lannigan

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral gastroenteritis research and epidemiology
Établissements canadiensLondon Health Sciences Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEntamoeba histolyticaGiardia lambliaMetronidazoleImmunoassayMedicineGiardiaFecesInternal medicinePathogenEntamoebaCryptosporidiumBiologyGastroenterologyMicrobiologyVeterinary medicineImmunologyAntibioticsAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In many clinical situations, stool examinations for ova and parasites (O&P) are routine in the work-up of patients with acute or chronic diarrhea. Frequently, these tests are found to be negative for pathogens. The purpose of this study was to examine the diagnostic yield of routine stool testing for O&P in a Canadian tertiary care centre and to estimate the potential clinical benefit of a positive result. PATIENTS AND METHODS: All stool samples sent to the central microbiology laboratory at London Health Sciences Centre were reviewed over a 5-year period ending January 2010. Initial screening was done by direct antigen testing using an enzyme immunoassay (EIA) technique followed by direct microscopy for negative results where there was a high index of suspicion and for positive results to rule out any concurrent parasites not included in the EIA kit. Pathogens identified were categorized and their potential susceptibility to metronidazole was estimated. No clinical data were available, as this was purely a utilization study. RESULTS: A total of 5812 stool tests were ordered. Of these, 5681 (97.7%) were completed. The most common reasons for an incomplete test were sample leakage (n = 38) and use of the incorrect collection kit (n = 32). Direct microscopy identified white blood cells in 17% of patients with positive testing. The most common pathogen was Giardia lamblia , which was detected in 45/83 (54%) of positive specimens. Entamoeba histolytica/Entamoeba dispar was identified in 16/83 (19%) and Cryptosporidium spp. in 10/83 (12%) of positive specimens. Microorganisms not thought to be pathogenic were identified in 7/83 (8%). Direct laboratory costs independent of labor were estimated at $1836 per clinically significant organism identified. Of the 77 specimens positive for pathogenic organisms, 62 (81%) were likely to be sensitive to treatment with metronidazole. CONCLUSION: In a tertiary care centre, the diagnostic yield of routine testing of stool for O&P during the evaluation of patients with acute or chronic diarrhea is low. Most clinically significant positive results should be responsive to metronidazole, but empirical treatment is not encouraged. Strategies to identify patients with a higher likelihood of harboring pathogenic parasites and consideration of empiric metronidazole therapy for patients at highest risk merit further research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil0,331

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0040,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2012
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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