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Enregistrement W2104897131 · doi:10.1139/b02-035

Genes for multicopper proteins and laccase activity: common features in plant-associated<i>Fusarium</i>isolates

2002· article· en· W2104897131 sur OpenAlexvenueno aff
Sun-Il Kwon, Anne J. Anderson

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEnzyme-mediated dye degradation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFusarium proliferatumLaccaseBiologyFusariumGeneGenomeHomology (biology)Multicopper oxidaseMicrobiologyGeneticsBotanyEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Eight Fusarium isolates from diverse plant habitats produced laccase activities when cultured on low-carbon medium. Three sequences with high homology to laccase genes were detected in the genome of Fusarium proliferatum, NRRL 31071, an opportunistic pathogen of wheat (Triticum spp.). The sequences aligned with laccase genes from Ascomycetes, whereas genes from other fungal taxonomic groups and from plants grouped separately. Sequences for related multicopper oxidases with ascorbate oxidase activity were also separated discretely. A fourth sequence from NRRL 31071 had highest homology to genes for multicopper proteins associated with ferrooxidase activities in yeasts. Each of the four sequences had high homology to sequences within the genome of a ligninolytic F. proliferatum from forest soil. RFLP analysis of the genomes of three other F. proliferatum isolates and a phylogenetically closely related isolate, Fusarium fujikuroi, showed that fragments hybridizing with the four multicopper oxidase genes were similar in size to those from the NRRL 31071 genome. Weaker hybridization was observed with the phylogenetically more distant Fusarium anthophilum. No hybridization was observed with an isolate of Fusarium culmorum, a wheat pathogen, from a different section of the genus Fusarium, although this isolate produced laccases.Key words: ferrooxidase, Fusarium proliferatum, laccase, multicopper oxidase.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,751
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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