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Enregistrement W2105195683 · doi:10.1002/cyto.1067

Measurement of MAP kinase activation by flow cytometry using phospho‐specific antibodies to MEK and ERK: Potential for pharmacodynamic monitoring of signal transduction inhibitors

2001· article· en· W2105195683 sur OpenAlexaff
Sue Chow, Harshna Patel, David W. Hedley

Notice bibliographique

RevueCytometry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMelanoma and MAPK Pathways
Établissements canadiensUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMAPK/ERK pathwaySignal transductionFlow cytometryKinaseMitogen-activated protein kinaseMEK inhibitorMitogen-activated protein kinase kinaseProtein kinase ABiologyCell biologyCancer researchProtein kinase CChemistryPharmacologyMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cancer cells frequently show abnormal signaling via the mitogen activated protein kinase (MAP kinase) pathway due to increased activity of surface receptors for growth factors, or as a result of ras mutations. The development of potent anti-cancer agents that target this pathway prompts the need for analytical methods that allow pharmacodynamic monitoring of drug effects in patients during early phase clinical trial. We describe such a method, based on the activation of T-lymphocytes in undiluted peripheral blood using phorbol myristate acetate (PMA). Following rapid hypotonic lysis and formaldehyde fixation, activation of the MAP kinase pathway can then be demonstrated using phospho-specific antibodies that recognize the activated mediators MEK or ERK, followed by surface labeling with anti-CD3 to identify T-lymphocytes. This method was used to investigate the effects of a MEK inhibitor, U0126, and a new raf kinase inhibitor BAY 37-9751 in blood samples from normal donors. Dose-dependent inhibition of pERK activation was demonstrated for both agents. Furthermore, differential effects on pMEK activation allowed the molecular targets of the two inhibitors to be distinguished. In addition to monitoring drug effects in patients during treatment with inhibitors of the MAP kinase pathway, the general methodology described in this paper has the potential for wide application to the study of signal transduction at the single cell level using flow cytometry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations178
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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