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Enregistrement W2105541548 · doi:10.1097/cmr.0000000000000141

LINE-1 hypermethylation in peripheral blood of cutaneous melanoma patients is associated with metastasis

2015· article· en· W2105541548 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMelanoma Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensSKiN Health
Organismes subventionnairesFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésCDKN2ADNA methylationEpigeneticsMethylationCpG siteMelanomaBiomarkerCancer researchMedicineMetastasisCancerOncologyBiologyInternal medicineDNAGeneticsGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aberrant DNA methylation pattern is a well-known epigenetic marker of cancer cells. Recently, aberrant methylation was also reported in the peripheral blood of cancer patients and it could potentially serve as a biomarker for cancer risk. We investigated the methylation pattern of LINE-1 and other repetitive DNA elements in peripheral blood of cutaneous melanoma patients in order to search for an association with clinical characteristics. The patient cohort was composed by 69 unrelated melanoma patients, 28 of whom were hereditary cases (with or without CDKN2A mutations) and 41 were isolated (sporadic) melanoma cases. Methylation of LINE-1 was evaluated by pyrosequencing, whereas additional repetitive DNA sequences were assessed using Illumina 450K methylation microarray. Melanoma patients exhibited a higher, albeit heterogeneous, LINE-1 methylation level compared with controls. Hereditary melanoma patients carrying CDKN2A mutations showed a hypermethylated pattern of both LINE-1 and repetitive DNA elements compared with other patients. In particular, the methylation level at one specific CpG of LINE-1 was found to be correlated with the occurrence of metastasis. Our data suggest that LINE-1 hypermethylation in peripheral blood of melanoma patients is a potential epigenetic biomarker for metastasis occurrence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,662
Score d'incertitude au seuil0,466

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle