Identification of genes involved in the assembly and attachment of a novel flagellin <i>N</i>‐linked tetrasaccharide important for motility in the archaeon <i>Methanococcus maripaludis</i>
Notice bibliographique
Résumé
Recently, the flagellin proteins of Methanococcus maripaludis were found to harbour an N-linked tetrasaccharide composed of N-acetylgalactosamine, di-acetylated glucuronic acid, an acetylated and acetamidino-modified mannuronic acid linked to threonine, and a novel terminal sugar [(5S)-2-acetamido-2,4-dideoxy-5-O-methyl-α-L-erythro-hexos-5-ulo-1,5-pyranose]. To identify genes involved in the assembly and attachment of this glycan, in-frame deletions were constructed in putative glycan assembly genes. Successful deletion of genes encoding three glycosyltransferases and an oligosaccharyltransferase (Stt3p homologue) resulted in flagellins of decreased molecular masses as evidenced by immunoblotting, indicating partial or completely absent glycan structures. Deletion of the oligosaccharyltransferase or the glycosyltransferase responsible for the transfer of the second sugar in the chain resulted in flagellins that were not assembled into flagella filaments, as evidenced by electron microscopy. Deletions of the glycosyltransferases responsible for the addition of the third and terminal sugars in the glycan were confirmed by mass spectrometry analysis of purified flagellins from these mutants. Although flagellated, these mutants had decreased motility as evidenced by semi-swarm plate analysis with the presence of each additional sugar improving movement capabilities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».