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Enregistrement W2105759732 · doi:10.1093/molbev/mss125

Non Conservation of Function for the Evolutionarily Conserved Prdm1 Protein in the Control of the Slow Twitch Myogenic Program in the Mouse Embryo

2012· article· en· W2105759732 sur OpenAlexfundno aff
Stéphane D. Vincent, Alicia Mayeuf-Louchart, Claire Niro, Mitinori Saitou, Margaret Buckingham

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology and Evolution · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCentre National de la Recherche ScientifiqueEuropean CommissionInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleInstitut national de la recherche scientifique
Mots-clésMyotomeMyogenesisMYF5BiologyMyoDSomiteMyogenic regulatory factorsCell biologyMyogeninNotochordPAX3MesodermMyocyteEmbryoGeneticsEmbryonic stem cellEmbryogenesisGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Muscles are composed of multinucleated muscle fibers with different contractile and physiological properties, which result from specific slow or fast gene expression programs in the differentiated muscle cells. In the zebra fish embryo, the slow program is under the control of Hedgehog signaling from the notochord and floor plate. This pathway activates the expression of the conserved transcriptional repressor, Prdm1 (Blimp1), which in turn represses the fast program and promotes the slow program in adaxial cells of the somite and their descendants. In the mouse embryo, myogenesis is also initiated in the myotomal compartment of the somite, but the slow muscle program is not confined to a specific subset of cells. We now show that Prdm1 is expressed in the first differentiated myocytes of the early myotome from embryonic day (E)9.5-E11.5. During this period, muscle formation depends on the myogenic regulatory factors, Myf5 and Mrf4. In their absence, Prdm1 is not activated, in apparent contrast to zebra fish where Prdm1 is expressed in the absence of Myf5 and MyoD that drive myogenesis in adaxial cells. However, as in zebra fish, Prdm1 expression in the mouse myotome does not occur in the absence of Hedgehog signaling. Analysis of the muscle phenotype of Prdm1 mutant embryos shows that myogenesis appears to proceed normally. Notably, there is no requirement for Prdm1 activation of the slow muscle program in the mouse myotome. Furthermore, the gene for the transcriptional repressor, Sox6, which is repressed by Prdm1 to permit slow muscle differentiation in zebra fish, is not expressed in the mouse myotome. We propose that the lack of functional conservation for mouse Prdm1, that can nevertheless partially rescue the adaxial cells of zebra fish Prdm1 mutants, reflects differences in the evolution of the role of key regulators such as Prdm1 or Sox6, in initiating the onset of the slow muscle program, between teleosts and mammals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,727
Score d'incertitude au seuil0,239

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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