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Enregistrement W2106091291 · doi:10.1093/carcin/bgt320

miR-200b suppresses invasiveness and modulates the cytoskeletal and adhesive machinery in esophageal squamous cell carcinoma cells via targeting Kindlin-2

2013· article· en· W2106091291 sur OpenAlexaff
Haifeng Zhang, Kai Zhang, Lian‐Di Liao, Liyan Li, Zepeng Du, Bingli Wu, Jian‐Yi Wu, Xiu‐E Xu, Fa‐Min Zeng, Bo Chen, Huihui Cao, Mengxiao Zhu, Lihua Dai, Lin Long, Zhiyong Wu, Raymond Lai, Li‐Yan Xu, En‐Min Li

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesGeneral Hospital of People’s Liberation ArmyChinese Academy of Medical SciencesChinese Academy of SciencesAcademy of Medical Sciences
Mots-clésGene knockdownDownregulation and upregulationCancer researchTransfectionFocal adhesionBiologymicroRNAActin cytoskeletonCell growthCell biologyCytoskeletonCell migrationMetastasisCellCell cultureSignal transductionCancerGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To further our understanding of the pathobiology of esophageal squamous cell carcinoma (ESCC), we previously performed microRNA profiling that revealed downregulation of miR-200b in ESCC. Using quantitative real-time PCR applied to 88 patient samples, we confirmed that ESCC tumors expressed significantly lower levels of miR-200b compared with the respective adjacent benign tissues (P = 0.003). Importantly, downregulation of miR-200b significantly correlated with shortened survival (P = 0.025), lymph node metastasis (P = 0.002) and advanced clinical stage (P = 0.020) in ESCC patients. Quantitative mass spectrometry identified 57 putative miR-200b targets, including Kindlin-2, previously implicated in the regulation of tumor invasiveness and actin cytoskeleton in other cell types. Enforced expression of miR-200b mimic in ESCC cells led to a decrease of Kindlin-2 expression, whereas transfection of miR-200b inhibitor induced Kindlin-2 expression. Furthermore, transfection of miR-200b mimic or knockdown of Kindlin-2 in ESCC cells decreased cell protrusion and focal adhesion (FA) formation, reduced cell spreading and invasiveness/migration. Enforced expression of Kindlin-2 largely abrogated the inhibitory effects of miR-200b on ESCC cell invasiveness. Mechanistic studies revealed that Rho-family guanosine triphosphatases and FA kinase mediated the biological effects of the miR-200b-Kindlin-2 axis in ESCC cells. To conclude, loss of miR-200b, a frequent biochemical defect in ESCC, correlates with aggressive clinical features. The tumor suppressor effects of miR-200b may be due to its suppression of Kindlin-2, a novel target of miR-200b that modulates actin cytoskeleton, FA formation and the migratory/invasiveness properties of ESCC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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