Quinolone Resistance in Canadian Neisseria gonorrhoeae Strains (2001–2005)
Notice bibliographique
Résumé
Background: To monitor quinolone resistance in Neisseria gonorrhoeae strains in Canada. Methods: N. gonorrhoeae strains were obtained from provincial public health and reference laboratories across Canada. MICs were determined by agar dilution for penicillin, spectinomycin, tetracycline, erythromycin, ceftriaxone, ciprofloxacin, cefixime, and azithromycin. Additional testing of the strain's auxotype, and plasmid profile were also determined. Results: From 2001–2005, 28035 strains of N. gonorrhoeae were tested by laboratories across Canada. Of these, 4522 resistant strains were characterized by the National Microbiology Laboratory. During this period, an increase in ciprofloxacin resistant strains, cipR, (MIC value ≥1.0 mg/L) was observed. In 2001, only 130 strains, or 2.9% of the strains tested nationally (n = 4498) were found to be resistant to ciprofloxacin. This rate increased to 6.2% (n = 4018) in 2004, and by 2005 the number of cipR strains increased to 570 accounting for 15.8% (n = 3619) of the year's total. From the 1159 cipR strains characterized during this time frame, the auxotype/plasmid profiles of NR/2.6 Mdal and P/2.6 Mdal were the most common, 33.7% and 31.8% respectively. Of the 1096 cipR strains characterized where the gender and age were known, 86.4% of the strains were from males. The majority of patient ages were between 20–39 for both genders, 65.0% for males and 64.4% for females. Conclusion: Ciprofloxacin resistance in N. gonorrhoeae within Canada has increased to a level where ciprofloxacin is no longer an option for treatment. The treatments now available are spectinomycin or the third generation cephalosporins, such as ceftriaxone and cefixime. A sentinel surveillance system is being considered to collect representative strains as more laboratories are shifting to nucleic acid based diagnosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».