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Enregistrement W2106731625 · doi:10.1002/pro.249

Controllable protein cleavages through intein fragment complementation

2009· article· en· W2106731625 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueProtein Science · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInteinCleavage (geology)ComplementationRecombinant DNAProtein engineeringProtein splicingChemistryProtein tagBiochemistryStereochemistryBiologyFusion proteinEnzymeGeneRNA splicing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Intein-based protein cleavages, if carried out in a controllable way, can be useful tools of recombinant protein purification, ligation, and cyclization. However, existing methods using contiguous inteins were often complicated by spontaneous cleavages, which could severely reduce the yield of the desired protein product. Here we demonstrate a new method of controllable cleavages without any spontaneous cleavage, using an artificial S1 split-intein consisting of an 11-aa N-intein (I(N)) and a 144-aa C-intein (I(C)). In a C-cleavage design, the I(C) sequence was embedded in a recombinant precursor protein, and the small I(N) was used as a synthetic peptide to trigger a cleavage at the C-terminus of I(C). In an N-cleavage design, the short I(N) sequence was embedded in a recombinant precursor protein, and the separately produced I(C) protein was used to catalyze a cleavage at the N-terminus of I(N). These N- and C-cleavages showed >95% efficiency, and both successfully avoided any spontaneous cleavage during expression and purification of the precursor proteins. The N-cleavage design also revealed an unexpected and interesting structural flexibility of the I(C) protein. These findings significantly expand the effectiveness of intein-based protein cleavages, and they also reveal important insights of intein structural flexibility and fragment complementation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,654

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle