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Enregistrement W2106923566 · doi:10.1128/mcb.06620-11

Regulation of Nucleocytoplasmic Shuttling of Bruton's Tyrosine Kinase (Btk) through a Novel SH3-Dependent Interaction with Ankyrin Repeat Domain 54 (ANKRD54)

2012· article· en· W2106923566 sur OpenAlexaff
Manuela O. Gustafsson, Alamdar Hussain, Abdalla J. Mohamed, Vivian Nguyen, Pavel Metalnikov, Karen Colwill, Tony Pawson, Beston F. Nore

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesPharmacyclics
Mots-clésBruton's tyrosine kinaseAnkyrin repeatLYNX-linked agammaglobulinemiaSH3 domainBiologyTyrosine kinaseTyrosineSrc family kinaseCell biologyKinaseMolecular biologyBiochemistrySignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bruton's tyrosine kinase (Btk), belonging to the Tec family of tyrosine kinases (TFKs), is essential for B-lymphocyte development. Abrogation of Btk signaling causes human X-linked agammaglobulinemia (XLA) and murine X-linked immunodeficiency (Xid). We employed affinity purification of Flag-tagged Btk, combined with tandem mass spectrometry, to capture and identify novel interacting proteins. We here characterize the interaction with ankryin repeat domain 54 protein (ANKRD54), also known as Lyn-interacting ankyrin repeat protein (Liar). While Btk is a nucleocytoplasmic protein, the Liar pool was found to shuttle at a higher rate than Btk. Importantly, our results suggest that Liar mediates nuclear export of both Btk and another TFK, Txk/Rlk. Liar-mediated Btk shuttling was enriched for activation loop, nonphosphorylated Btk and entirely dependent on Btk's SH3 domain. Liar also showed reduced binding to an aspartic acid phosphomimetic SH3 mutant. Three other investigated nucleus-located proteins, Abl, estrogen receptor β (ERβ), and transcription factor T-bet, were all unaffected by Liar. We mapped the interaction site to the C terminus of the Btk SH3 domain. A biotinylated, synthetic Btk peptide, ARDKNGQEGYIPSNYVTEAEDS, was sufficient for this interaction. Liar is the first protein identified that specifically influences the nucleocytoplasmic shuttling of Btk and Txk and belongs to a rare group of known proteins carrying out this activity in a Crm1-dependent manner.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,767

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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