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Enregistrement W2107088171 · doi:10.1128/mcb.20.12.4199-4209.2000

Two Regulators of Ste12p Inhibit Pheromone-Responsive Transcription by Separate Mechanisms

2000· article· en· W2107088171 sur OpenAlexaff
Karen A. Olson, Christopher J. Nelson, Georgia Tai, Wesley Hung, Carl Yong, Caroline R. Astell, Ivan Sadowski

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySaccharomyces cerevisiaeTranscription factorFusion proteinTranscription (linguistics)PromoterGeneMolecular biologyRepressor lexABiochemistryCell biologyGeneticsRecombinant DNAGene expressionRepressor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The yeast Saccharomyces cerevisiae transcription factor Ste12p is responsible for activating genes in response to MAP kinase cascades controlling mating and filamentous growth. Ste12p is negatively regulated by two inhibitor proteins, Dig1p (also called Rst1p) and Dig2p (also called Rst2p). The expression of a C-terminal Ste12p fragment (residues 216 to 688) [Ste12p(216-688)] from a GAL promoter causes FUS1 induction in a strain expressing wild-type STE12, suggesting that this region can cause the activation of endogenous Ste12p. Residues 262 to 594 are sufficient to cause STE12-dependent FUS1 induction when overexpressed, and this region of Ste12p was found to bind Dig1p but not Dig2p in yeast extracts. In contrast, recombinant glutathione S-transferase-Dig2p binds to the Ste12p DNA-binding domain (DBD). Expression of DIG2, but not DIG1, from a GAL promoter inhibits transcriptional activation by an Ste12p DBD-VP16 fusion. Furthermore, disruption of dig1, but not dig2, causes elevated transcriptional activation by a LexA-Ste12p(216-688) fusion. Ste12p has multiple regions within the C terminus (flanking residue 474) that can promote multimerization in vitro, and we demonstrate that these interactions can contribute to the activation of endogenous Ste12p by overproduced C-terminal fragments. These results demonstrate that Dig1p and Dig2p do not function by redundant mechanisms but rather inhibit pheromone-responsive transcription through interactions with separate regions of Ste12p.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,805

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations91
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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